RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 PCDH1Q08174 1060 aa1.32□□□□□ -2.2
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP1.32□□□□□ -2.2
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RNU6-871P-201ENST00000516122 LARGE2Q8N3Y3 721 aa1.32□□□□□ -2.2
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RNU6-871P-201ENST00000516122 KRT4P19013 534 aa1.31□□□□□ -2.2
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
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RNU6-871P-201ENST00000516122 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
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RNU6-871P-201ENST00000516122 RFX1P22670 979 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 WEE1P30291 646 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERVK-24P63145 666 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXO4P98177 505 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTH1RQ03431 593 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 GRM2Q14416 872 aa1.26□□□□□ -2.21
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARMCX6Q7L4S7 300 aa1.26□□□□□ -2.21
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