RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 OTUD5Q96G74 571 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.99■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 CXCL11O14625 94 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 ECE1P42892 770 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 ANAPC15P60006 121 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 HTRA3P83110 453 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 ICA1Q05084 483 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 NYAP2Q9P242 653 aa24.98■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 IRF6O14896 467 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 CYP4F22Q6NT55 531 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 CEP95Q96GE4 821 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 CAPNS2Q96L46 248 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 MTA3Q9BTC8 594 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.97■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 IQCA1Q86XH1 822 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 NEK1Q96PY6 1258 aa24.96■■□□□ 1.59
ACTN3-202ENST00000511191 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 SPP2Q13103 211 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 NOGQ13253 232 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MKL1Q969V6 931 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 C19orf81C9J6K1 198 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L10C9JJH3 530 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 NMT2O60551 498 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TTLL1O95922 423 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 GTF2A2P52657 109 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 BACE1P56817 501 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 SNAPC2Q13487 334 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 DGKHQ86XP1 1220 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ANKS1AQ92625 1134 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MS4A4AQ96JQ5 239 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TTC14Q96N46 770 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 SH2D4AQ9H788 454 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TMX2Q9Y320 296 aa24.94■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 A0A1W2PRG0 241 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM75PA6NK02 468 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 PSMA5P28066 241 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MCM5P33992 734 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 VEGFBP49765 207 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ANTXR2P58335 489 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ACER1Q8TDN7 264 aa24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.92■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 CETPP11597 493 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 USP14P54578 494 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MTMR2Q13614 643 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 C12orf42Q96LP6 360 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.91■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TNKSO95271 1327 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 PRC1O43663 620 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MAP2K2P36507 400 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 INHBEP58166 350 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 MOGSQ13724 837 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 SEC23AQ15436 765 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TMEM87BQ96K49 555 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 FEZ1Q99689 392 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 STX8Q9UNK0 236 aa24.9■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ACTN3-202ENST00000511191 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms