RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 TDO2P48775 406 aa27.95■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.95■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 RILPL2Q969X0 211 aa27.95■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.95■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 OSBPP22059 807 aa27.94■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 ARHGEF6Q15052 776 aa27.94■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.94■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 PSMC4P43686 418 aa27.93■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 PDE4AP27815 886 aa27.92■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.92■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.92■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.92■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 TRIM47Q96LD4 638 aa27.92■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 FAM227BQ96M60 508 aa27.92■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa27.92■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 A0A1W2PRG0 241 aa27.91■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 CCDC17Q96LX7 622 aa27.91■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 MGAMO43451 1857 aa27.91■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 HTTP42858 3142 aa27.91■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 A0A0D9SFI3 127 aa27.9■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 FOXP2O15409 715 aa27.9■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 C12orf42Q96LP6 360 aa27.9■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 NACAP1Q9BZK3 213 aa27.9■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.9■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 DOCK3Q8IZD9 2030 aa27.89■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 USP14P54578 494 aa27.89■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 VPS53Q5VIR6 699 aa27.89■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.89■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa27.89■■■□□ 2.06
STRADB-209ENST00000488196 ROBO3Q96MS0 1386 aa27.88■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 NAPBQ9H115 298 aa27.88■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 VCAM1P19320 739 aa27.87■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 RASA1P20936 1047 aa27.87■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 ICA1Q05084 483 aa27.87■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa27.87■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.87■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 PEX10O60683 326 aa27.86■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 GNRH1P01148 92 aa27.86■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 SDSP20132 328 aa27.86■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 FCGRTP55899 365 aa27.86■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 HERVK_113P62684 666 aa27.86■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.86■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 TICAM2Q86XR7 235 aa27.86■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 PRDM1O75626 825 aa27.85■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 SOX10P56693 466 aa27.85■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 SRRDQ9UH36 339 aa27.85■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L15C9J2P7 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L11C9JVI0 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L18D6R9N7 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L22D6RA61 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L19D6RCP7 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L20D6RJB6 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 HOXD10P28358 340 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 ATP2B2Q01814 1243 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 PPARAQ07869 468 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 USP17L24Q0WX57 530 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.84■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 POTEEQ6S8J3 1075 aa27.83■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa27.83■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.83■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 TXNRD2Q9NNW7 524 aa27.83■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
STRADB-209ENST00000488196 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 PRKCZQ05513 592 aa27.82■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 MORF4L1Q9UBU8 362 aa27.82■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 GABRQQ9UN88 632 aa27.82■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 TMX2Q9Y320 296 aa27.82■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 MYPNQ86TC9 1320 aa27.82■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 PRMT2P55345 433 aa27.81■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 RBPJLQ9UBG7 517 aa27.81■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 CENPFP49454 3210 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 CTDSPL2Q05D32 466 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 TTC22Q5TAA0 569 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 ARMC5Q96C12 935 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 PAGR1Q9BTK6 254 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 ZNF287Q9HBT7 754 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 CCDC171Q6TFL3 1326 aa27.8■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
STRADB-209ENST00000488196 PDE4BQ07343 736 aa27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 251.6 ms