RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 RILPL2Q969X0 211 aa12.87□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 EFCC1Q9HA90 598 aa12.87□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 CENPFP49454 3210 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC85CA6NKD9 419 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 C19orf81C9J6K1 198 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 APPP05067 770 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 GNAT2P19087 354 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TDO2P48775 406 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 SKAP1Q86WV1 359 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 C12orf42Q96LP6 360 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 CABP5Q9NP86 173 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 HELLSQ9NRZ9 838 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 PTPN22Q9Y2R2 807 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TACC3Q9Y6A5 838 aa12.86□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 ROBO3Q96MS0 1386 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 PRDM1O75626 825 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 SDSP20132 328 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 RASA1P20936 1047 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L2Q6R6M4 530 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM179Q6ZVK1 233 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM47Q96LD4 638 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 INCENPQ9NQS7 918 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TMOD4Q9NZQ9 345 aa12.85□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 VCAM1P19320 739 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 PSMC4P43686 418 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TTC22Q5TAA0 569 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 AMOTL1Q8IY63 956 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 FEZ1Q99689 392 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 IL25Q9H293 177 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TXNRD2Q9NNW7 524 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa12.84□□□□□ -0.35
ATG4B-210ENST00000428861 EEF2P13639 858 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 OSBPP22059 807 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 ICA1Q05084 483 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 PPARAQ07869 468 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC17Q96LX7 622 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 NAPBQ9H115 298 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 PNMA3Q9UL41 463 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 BRCA2P51587 3418 aa12.83□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 CNMDO75829 334 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 FGAP02671 866 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 HERVK_113P62684 666 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 CTDSPL2Q05D32 466 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 Q3C1V9 767 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 TICAM2Q86XR7 235 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 NACAP1Q9BZK3 213 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 RBPJLQ9UBG7 517 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 GABRQQ9UN88 632 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC171Q6TFL3 1326 aa12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP14P54578 494 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 SOX10P56693 466 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 PRKCZQ05513 592 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 KIF22Q14807 665 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 ALX1Q15699 326 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 FAM110CQ1W6H9 321 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 FAM47AQ5JRC9 791 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 SPICE1Q8N0Z3 855 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 MKNK2Q9HBH9 465 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 SRRDQ9UH36 339 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 TMX2Q9Y320 296 aa12.81□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 MYH8P13535 1937 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L15C9J2P7 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L13C9JLJ4 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L11C9JVI0 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L18D6R9N7 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L22D6RA61 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L17D6RBQ6 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L19D6RCP7 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L20D6RJB6 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 ATP2B2Q01814 1243 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 USP17L24Q0WX57 530 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 NBPF3Q9H094 633 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 VCPKMTQ9H867 229 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 KANSL2Q9H9L4 492 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 MORF4L1Q9UBU8 362 aa12.8□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
ATG4B-210ENST00000428861 FCGRTP55899 365 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms