RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307106.3

SMIM4-201, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMIM4, Length 274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-201ENST00000307106 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SMIM4-201ENST00000307106 PARP14Q460N5 1801 aa14.63□□□□□ -0.07
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SMIM4-201ENST00000307106 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.62□□□□□ -0.07
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SMIM4-201ENST00000307106 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.61□□□□□ -0.07
SMIM4-201ENST00000307106 USP17L11C9JVI0 530 aa14.61□□□□□ -0.07
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SMIM4-201ENST00000307106 USP17L20D6RJB6 530 aa14.61□□□□□ -0.07
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SMIM4-201ENST00000307106 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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SMIM4-201ENST00000307106 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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SMIM4-201ENST00000307106 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
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SMIM4-201ENST00000307106 RAG1P15918 1043 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 FPGSQ05932 587 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 LRRC41Q15345 812 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 LBX2Q6XYB7 198 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 TIFAQ96CG3 184 aa14.58□□□□□ -0.08
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SMIM4-201ENST00000307106 LRP2BPQ9P2M1 347 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 PALD1Q9ULE6 856 aa14.58□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 FLT1P17948 1338 aa14.58□□□□□ -0.08
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SMIM4-201ENST00000307106 PLCG2P16885 1265 aa14.57□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 ADORA2AP29274 412 aa14.57□□□□□ -0.08
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SMIM4-201ENST00000307106 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.56□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 PHF24Q9UPV7 400 aa14.56□□□□□ -0.08
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SMIM4-201ENST00000307106 BDP1A6H8Y1 2624 aa14.56□□□□□ -0.08
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SMIM4-201ENST00000307106 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 HLA-DOAP06340 250 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 GORABQ5T7V8 394 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.55□□□□□ -0.08
SMIM4-201ENST00000307106 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
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