RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287263.8

RAB11FIP1-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP1, Length 6,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NPATQ14207 1427 aa16.02■□□□□ 0.16
RAB11FIP1-201ENST00000287263 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 STRN3Q13033 797 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TRAF1Q13077 416 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 FAM227BQ96M60 508 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF75DP51815 510 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NSD2O96028 1365 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PPIP5K2O43314 1243 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 STMN1P16949 149 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.02■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 BMP15O95972 392 aa16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 BEND3Q5T5X7 828 aa16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ABCC1P33527 1531 aa16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PTPROQ16827 1216 aa16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 LMBR1Q8WVP7 490 aa16.01■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SPOPO43791 374 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GADL1Q6ZQY3 521 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 JAKMIP2Q96AA8 810 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CBX8Q9HC52 389 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GMNNO75496 209 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GTF2IP78347 998 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TACC3Q9Y6A5 838 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SMC5Q8IY18 1101 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SNX21Q969T3 373 aa16■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TUBBP07437 444 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZNF790Q6PG37 636 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SESTD1Q86VW0 696 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 IFT20Q8IY31 132 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 STX10O60499 249 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 IGSF22Q8N9C0 903 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 FLT4P35916 1363 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SLC1A4P43007 532 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 KCNQ4P56696 695 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 IFT88Q13099 833 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 HHATQ5VTY9 493 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CCDC26Q8TAB7 109 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ATP5DP30049 168 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PPFIA1Q13136 1202 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TNNI3KQ59H18 835 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 BSPRYQ5W0U4 402 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NIM1KQ8IY84 436 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MYCT1Q8N699 235 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 CUL7Q14999 1698 aa15.99■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TNFAIP3P21580 790 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TCP11Q8WWU5 503 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 EFCC1Q9HA90 598 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SMTNP53814 917 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 VAMP4O75379 141 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SH2D4AQ9H788 454 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 MYO1AQ9UBC5 1043 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 IL16Q14005 1332 aa15.98■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GPAA1O43292 621 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 AZI2Q9H6S1 392 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 PRPHP41219 470 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 SPAG1Q07617 926 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 KRT71Q3SY84 523 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 KCTD16Q68DU8 428 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ZBED4O75132 1171 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 GCNT3O95395 438 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 IGBP1P78318 339 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TCIRG1Q13488 830 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 RILPQ96NA2 401 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.97■□□□□ 0.15
RAB11FIP1-201ENST00000287263 ASXL2Q76L83 1435 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms