RNA–Protein interactions for RNA: YER017C

AFG3, Transcript of Mitochondrial inner membrane m-AAA protease component, yeast

Gene AFG3, Length 2,286 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AFG3	YER017C	MDJ2	P42834	146 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ACL4	Q03771	387 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	RSC2	Q06488	889 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SWC7	Q06707	132 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	INO1	P11986	533 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.31	□□□□□ -1.24	not detected
AFG3	YER017C	RGR1	P19263	1082 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SIN4	P32259	974 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	NUP120	P35729	1037 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SIF2	P38262	535 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	TEL2	P53038	688 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	TIM13	P53299	105 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YPR202W	Q08993	238 aa		7.31	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YPR089W	O13585	888 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	VPS34	P22543	875 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	BUD14	P27637	709 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	BIO2	P32451	375 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	UIP5	P36137	443 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	FHL1	P39521	936 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	MEF2	P39677	819 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YDR476C	Q03362	224 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	NHX1	Q04121	633 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	HFD1	Q04458	532 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	PEX15	Q08215	383 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	MPH2	P0CD99	609 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ATP12	P22135	325 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	TSC10	P38342	320 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YIL001W	P40560	513 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	CSN9	Q03981	162 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YET2	Q04210	160 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YKU80	Q04437	629 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	PMT7	Q06644	662 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ENT4	Q07872	247 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	AFI1	Q99222	893 aa		7.3	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	COX5A	P00424	153 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	AMD2	P22580	549 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SRP101	P32916	621 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ASK1	P35734	292 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YBR284W	P38150	797 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	CTP1	P38152	299 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ATG12	P38316	186 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	JEM1	P40358	645 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YFL040W	P43562	540 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	MIG2	P53035	382 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	VPS62	P53285	467 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	GND2	P53319	492 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	COS6	P53344	381 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YMR155W	Q03795	547 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	GRX8	Q05926	109 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SRF1	Q12516	437 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	CLB4	P24871	460 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SPR1	P32603	445 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	BEM3	P32873	1128 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YHR202W	P38887	602 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SNG1	P46950	547 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SIW14	P53965	281 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	TRS31	Q03337	283 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	APM4	Q99186	491 aa		7.29	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	COX6	P00427	148 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	RHO2	P06781	192 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	MEF1	P25039	761 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	MSH2	P25847	964 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ADK2	P26364	225 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	DSS4	P32601	143 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	HES1	P35843	434 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	YHR182W	P38870	785 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SPP1	Q03012	353 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	INP2	Q03824	705 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	BCP1	Q06338	283 aa		7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	MET4	P32389	672 aa		7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	PAH1	P32567	862 aa		7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	HMT1	P38074	348 aa		7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SLX1	P38324	304 aa		7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	BZZ1	P38822	633 aa		7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	SLX8	P40072	274 aa		7.27	□□□□□ -1.24
AFG3	YER017C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24

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