RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580004.1

NEK4P2-201, Transcript of NIMA-related kinase 4 pseudogene 2, humanhuman

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Gene NEK4P2, Length 1,012 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P2-201ENST00000580004 WDR18Q9BV38 432 aa22.39■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.38■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 M0R2C6 588 aa22.38■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.38■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.38■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.38■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L12C9JPN9 530 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L21D6R901 530 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 HIP1O00291 1037 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 NEFLP07196 543 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 SHMT1P34896 483 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 MOGSQ13724 837 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.37■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 BTBD19C9JJ37 291 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 GPR25O00155 361 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 TBC1D8O95759 1140 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 PDE4AP27815 886 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 CTR9Q6PD62 1173 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 RILPL2Q969X0 211 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 CABP5Q9NP86 173 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.36■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 CRHR2Q13324 411 aa22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 CCDC17Q96LX7 622 aa22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 TRIM75PA6NK02 468 aa22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 C19orf81C9J6K1 198 aa22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 GDF11O95390 407 aa22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 TDO2P48775 406 aa22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 SPP2Q13103 211 aa22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.34■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 GH2P01242 217 aa22.33■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 APPP05067 770 aa22.33■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 CYP2D6P10635 497 aa22.33■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 TTC22Q5TAA0 569 aa22.33■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NEK4P2-201ENST00000580004 PDHXO00330 501 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TLR2O60603 784 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 FKTNO75072 461 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SDSP20132 328 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 BACE1P56817 501 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 JAG1P78504 1218 aa22.32■■□□□ 1.16
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NEK4P2-201ENST00000580004 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.32■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ZMYM6O95789 1325 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L10C9JJH3 530 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CDK8P49336 464 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
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NEK4P2-201ENST00000580004 NAPBQ9H115 298 aa22.31■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 A0A0D9SFI3 127 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ALX1Q15699 326 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 FAM227BQ96M60 508 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PNMA3Q9UL41 463 aa22.3■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.29■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 USP14P54578 494 aa22.29■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 EVX2Q03828 476 aa22.29■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.29■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.29■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 HMGCS2P54868 508 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SP3Q02447 781 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 MTMR2Q13614 643 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 TNS4Q8IZW8 715 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ERO1AQ96HE7 468 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.28■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 GUCY1A2P33402 732 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 ARHGEF6Q15052 776 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.27■■□□□ 1.16
NEK4P2-201ENST00000580004 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.27■■□□□ 1.16
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