RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-215	ENST00000563295	CAP1	Q01518	475 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	MYH1	P12882	1939 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	GH2	P01242	217 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	BCR	P11274	1271 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	MX1	P20591	662 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	HOXD10	P28358	340 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	PSMC4	P43686	418 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	PRMT2	P55345	433 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SOX10	P56693	466 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	MTMR2	Q13614	643 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	TREML2	Q5T2D2	321 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	CABP5	Q9NP86	173 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SIPA1L1	O43166	1804 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	PRKAB2	O43741	272 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	CHGB	P05060	677 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	OSBP	P22059	807 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SHMT1	P34896	483 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	GABPA	Q06546	454 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIFC3-215	ENST00000563295	PTPRF	P10586	1907 aa		11.96	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	FCGRT	P55899	365 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	APPBP2	Q92624	585 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	ARMC5	Q96C12	935 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	SWAP70	Q9UH65	585 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	USP17L21	D6R901	530 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	CYP2D6	P10635	497 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	CTGF	P29279	349 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	USP14	P54578	494 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	OSBP2	Q969R2	916 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	FEZ1	Q99689	392 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	GNAT2	P19087	354 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	RAET1E	Q8TD07	263 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	CCDC17	Q96LX7	622 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	FSD1	Q9BTV5	496 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	MYH7	P12883	1935 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	MYPN	Q86TC9	1320 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	GUCY1A2	P33402	732 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIFC3-215	ENST00000563295	CDK8	P49336	464 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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