RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.55■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTH1RQ03431 593 aa28.54■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.54■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.54■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.54■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPRAP18433 802 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPATQ06203 517 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NOGQ13253 232 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OTUD5Q96G74 571 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF287Q9HBT7 754 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa28.53■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ASNSP08243 561 aa28.52■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GJA5P36382 358 aa28.52■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 JAG1P78504 1218 aa28.52■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.52■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDE4BQ07343 736 aa28.52■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.52■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AOC2O75106 756 aa28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HAND2P61296 217 aa28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPIL2Q13356 520 aa28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC17Q96LX7 622 aa28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MKNK2Q9HBH9 465 aa28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GH2P01242 217 aa28.5■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CABP5Q9NP86 173 aa28.5■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.5■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF213O14771 459 aa28.49■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RASA1P20936 1047 aa28.49■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP4K1Q92918 833 aa28.49■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPRFP10586 1907 aa28.49■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP17L5A8MUK1 530 aa28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRDM1O75626 825 aa28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AKR1B1P15121 316 aa28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAP2K2P36507 400 aa28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBC1D2Q9BYX2 928 aa28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NBPF3Q9H094 633 aa28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.48■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IRF6O14896 467 aa28.47■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZIC5Q96T25 663 aa28.47■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.47■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CEP350Q5VT06 3117 aa28.47■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGRP09769 529 aa28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AS3MTQ9HBK9 375 aa28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.46■■■□□ 2.15
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ORC4O43929 436 aa28.45■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GUCY1A2P33402 732 aa28.45■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.45■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.45■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GTF2A2P52657 109 aa28.44■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SEPT2Q15019 361 aa28.44■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WDR18Q9BV38 432 aa28.44■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 INCENPQ9NQS7 918 aa28.44■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CXCL11O14625 94 aa28.43■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SNAPC2Q13487 334 aa28.43■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.43■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF280CQ8ND82 737 aa28.43■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.43■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.42■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP21A2P08686 494 aa28.42■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SREBF2Q12772 1141 aa28.42■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TOMM22Q9NS69 142 aa28.42■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRIM75PA6NK02 468 aa28.41■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 REC8O95072 547 aa28.41■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPP2Q13103 211 aa28.41■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.41■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NEDD4P46934 1319 aa28.41■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TSPY3P0CV98 308 aa28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TSPY8P0CW00 308 aa28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CETPP11597 493 aa28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 INHBEP58166 350 aa28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 JMYQ8N9B5 988 aa28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.39■■■□□ 2.14
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms