RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548981.5

CSRNP2-204, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CSRNP2, Length 845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-204ENST00000548981 MYH7P12883 1935 aa26.68■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 GNRH1P01148 92 aa26.67■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 HMGCS2P54868 508 aa26.67■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 ARMC5Q96C12 935 aa26.67■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 TRIM47Q96LD4 638 aa26.67■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 ARMT1Q9H993 441 aa26.67■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.67■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 PSMC4P43686 418 aa26.66■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 UBE3CQ15386 1083 aa26.66■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.66■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 BACE1P56817 501 aa26.65■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 EVX2Q03828 476 aa26.65■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 MBD4O95243 580 aa26.64■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 GABPAQ06546 454 aa26.64■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 MTMR2Q13614 643 aa26.64■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.64■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.64■■□□□ 1.86
CSRNP2-204ENST00000548981 PRKAB2O43741 272 aa26.63■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 GH2P01242 217 aa26.63■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 SHMT1P34896 483 aa26.63■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 PRMT2P55345 433 aa26.63■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 GPATCH3Q96I76 525 aa26.63■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 MGAMO43451 1857 aa26.62■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 OSBPP22059 807 aa26.62■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.62■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 SRRDQ9UH36 339 aa26.62■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 PNMA3Q9UL41 463 aa26.62■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 C19orf81C9J6K1 198 aa26.61■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 USP17L10C9JJH3 530 aa26.61■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.61■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 ZNF333Q96JL9 665 aa26.61■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.61■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 CYP2D6P10635 497 aa26.6■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.6■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 BRCA2P51587 3418 aa26.6■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 HOXD10P28358 340 aa26.59■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.59■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 TMOD4Q9NZQ9 345 aa26.59■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.59■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 FCGRTP55899 365 aa26.58■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa26.58■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.58■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.58■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CSRNP2-204ENST00000548981 POTEFA5A3E0 1075 aa26.57■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 GUCY1A2P33402 732 aa26.57■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 NBPF11Q86T75 865 aa26.57■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.57■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.57■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 FAM110CQ1W6H9 321 aa26.56■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.56■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.56■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 MYPNQ86TC9 1320 aa26.56■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 SMIM22K7EJ46 135 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 PRKCZQ05513 592 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 C12orf60Q5U649 245 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 CABP5Q9NP86 173 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 GABRQQ9UN88 632 aa26.55■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 AAMPQ13685 434 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 ACER1Q8TDN7 264 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 OSBP2Q969R2 916 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 GCC1Q96CN9 775 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 C12orf42Q96LP6 360 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 SWAP70Q9UH65 585 aa26.54■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 USP17L12C9JPN9 530 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 USP17L21D6R901 530 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 ERC2O15083 957 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 SEPT2Q15019 361 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 APPBP2Q92624 585 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 MORF4L1Q9UBU8 362 aa26.53■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 MX1P20591 662 aa26.52■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 RAET1EQ8TD07 263 aa26.52■■□□□ 1.84
CSRNP2-204ENST00000548981 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms