RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	AOC2	O75106	756 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	GIPR	P48546	466 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ADGRE1	Q14246	886 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	CUL7	Q14999	1698 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0A0MRY4	1105 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ADAM11	O75078	769 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	HTR3B	O95264	441 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	PGR	P06401	933 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	RAB33A	Q14088	237 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ACAD11	Q709F0	780 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FBXO11	Q86XK2	927 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	WDR18	Q9BV38	432 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	PIF1	Q9H611	641 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ST7	Q9NRC1	585 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL3	Q9UH77	587 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	GFRA2	O00451	464 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	GRK4	P32298	578 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ID3	Q02535	119 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	GRIK4	Q16099	956 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	TSPOAP1	O95153	1857 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	KLF4	O43474	513 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ATE1	O95260	518 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	DLGAP3	O95886	979 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	MBTPS1	Q14703	1052 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FXN	Q16595	210 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	PPM1J	Q5JR12	505 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	MKL1	Q969V6	931 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TLDC2	A0PJX2	215 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DDAH1	O94760	285 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CHMP4BP1	P59074	171 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	FDX2	Q6P4F2	183 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DYM	Q7RTS9	669 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SLC51A	Q86UW1	340 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	FAM13C	Q8NE31	585 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TM9SF2	Q99805	663 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PIDD1	Q9HB75	910 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GMIP	Q9P107	970 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	BTBD11	A6QL63	1104 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	DLL1	O00548	723 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	TMPRSS2	O15393	492 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	CLSTN1	O94985	981 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	WISP1	O95388	367 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GLI2	P10070	1586 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	RAG1	P15918	1043 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SELP	P16109	830 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	GUCY2C	P25092	1073 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	ERVK-24	P63145	666 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	SERINC3	Q13530	473 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MDM2-223	ENST00000536089	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		5.95	□□□□□ -1.46

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