RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513056.5

FAM53C-211, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53C, Length 923 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-211ENST00000513056 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 FLT1P17948 1338 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 MAPK4P31152 587 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 HERVK_113P62684 666 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 LRCH3Q96II8 777 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 COL6A3P12111 3177 aa22.4■■□□□ 1.18
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L10C9JJH3 530 aa22.39■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.39■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.39■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.39■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 MYH1P12882 1939 aa22.39■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 CYP2B6P20813 491 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 JAG1P78504 1218 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 TNNI3KQ59H18 835 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.38■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 POLA2Q14181 598 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 PDE3AQ14432 1141 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 USP6NLQ92738 828 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.37■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 ERVK-9P63128 1117 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 ERVK-24P63145 666 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 SNRKQ9NRH2 765 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 PALD1Q9ULE6 856 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.36■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 PFASO15067 1338 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 HLA-DOAP06340 250 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 CERS3Q8IU89 383 aa22.35■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 GDF11O95390 407 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 COL6A1P12109 1028 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 RGS2P41220 211 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 MORN1Q5T089 497 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 SSH3Q8TE77 659 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 C12orf42Q96LP6 360 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 APBA2Q99767 749 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.34■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 GPR142Q7Z601 462 aa22.33■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 TDHQ8IZJ6 230 aa22.33■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 PORCNQ9H237 461 aa22.33■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 TNNQ9UQP3 1299 aa22.33■■□□□ 1.17
FAM53C-211ENST00000513056 PEX10O60683 326 aa22.32■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 Q3C1V9 767 aa22.32■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.32■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.32■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 CCER2I3L3R5 266 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 DLL1O00548 723 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 BCAR3O75815 825 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 SYN1P17600 705 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 ZAP70P43403 619 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 ATP8B2P98198 1209 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 LHX8Q68G74 356 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 EHD4Q9H223 541 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.31■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 CCNA1P78396 465 aa22.3■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 MAP2K5Q13163 448 aa22.3■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.3■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L15C9J2P7 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L11C9JVI0 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L18D6R9N7 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L22D6RA61 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L19D6RCP7 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 USP17L20D6RJB6 530 aa22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
FAM53C-211ENST00000513056 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.7 ms