RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM212AQ96EL1 285 aa18.63■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAP2Q9UGK3 403 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM170AA1A519 330 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM23A6NLE4 172 aa18.63■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCP10Q12799 353 aa18.63■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNCQ9H7C4 482 aa18.63■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GGA1Q9UJY5 639 aa18.62■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADALQ6DHV7 355 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERO1AQ96HE7 468 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PI16Q6UXB8 463 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.61■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAK1Q13153 545 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC65Q8IXS2 484 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLVAPQ9BX97 442 aa18.61■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTCH1Q13635 1447 aa18.61■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.6■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EYA3Q99504 573 aa18.6■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRIPAP1Q4V328 841 aa18.59■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADGRB1O14514 1584 aa18.59■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC1A4P43007 532 aa18.59■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC25Q86WR0 208 aa18.59■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSH2Q76I76 1423 aa18.58■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NELFCDQ8IXH7 590 aa18.58■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.58■□□□□ 0.57
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC155Q8N6L0 562 aa18.58■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYRIPQ8NFW9 859 aa18.58■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNKSO95271 1327 aa18.58■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.58■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FANCBQ8NB91 859 aa18.58■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JDP2Q8WYK2 163 aa18.58■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HARSP12081 509 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.57■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP6O43182 974 aa18.57■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRINP3Q76B58 766 aa18.57■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USH1GQ495M9 461 aa18.57■□□□□ 0.56
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGS12O14924 1447 aa18.57■□□□□ 0.56
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