RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.87■■■□□ 2.21
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SMKR1-201ENST00000462322 CYP2C8P10632 490 aa28.86■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 WDR18Q9BV38 432 aa28.86■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.86■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.86■■■□□ 2.21
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa28.85■■■□□ 2.21
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SMKR1-201ENST00000462322 CYP2D6P10635 497 aa28.84■■■□□ 2.21
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SMKR1-201ENST00000462322 SHMT1P34896 483 aa28.83■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 CAP1Q01518 475 aa28.83■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 EVX2Q03828 476 aa28.83■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 TREML2Q5T2D2 321 aa28.83■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 SMC5Q8IY18 1101 aa28.83■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 APPBP2Q92624 585 aa28.83■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 FSD1Q9BTV5 496 aa28.83■■■□□ 2.21
SMKR1-201ENST00000462322 ADGRA2Q96PE1 1338 aa28.83■■■□□ 2.21
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SMKR1-201ENST00000462322 MTMR2Q13614 643 aa28.82■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.82■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 SH3D19Q5HYK7 790 aa28.82■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.82■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 AMOTL1Q8IY63 956 aa28.82■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 OSBP2Q969R2 916 aa28.82■■■□□ 2.2
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SMKR1-201ENST00000462322 STAP2Q9UGK3 403 aa28.81■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 USP17L10C9JJH3 530 aa28.8■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 PDE1AP54750 535 aa28.8■■■□□ 2.2
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SMKR1-201ENST00000462322 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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SMKR1-201ENST00000462322 PNMA3Q9UL41 463 aa28.8■■■□□ 2.2
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SMKR1-201ENST00000462322 USP17L12C9JPN9 530 aa28.79■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 USP17L21D6R901 530 aa28.79■■■□□ 2.2
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SMKR1-201ENST00000462322 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.78■■■□□ 2.2
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SMKR1-201ENST00000462322 BCRP11274 1271 aa28.77■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.77■■■□□ 2.2
SMKR1-201ENST00000462322 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.77■■■□□ 2.2
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SMKR1-201ENST00000462322 CTR9Q6PD62 1173 aa28.76■■■□□ 2.19
SMKR1-201ENST00000462322 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.76■■■□□ 2.19
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SMKR1-201ENST00000462322 CTGFP29279 349 aa28.72■■■□□ 2.19
SMKR1-201ENST00000462322 CDK8P49336 464 aa28.72■■■□□ 2.19
SMKR1-201ENST00000462322 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
SMKR1-201ENST00000462322 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
SMKR1-201ENST00000462322 ACER1Q8TDN7 264 aa28.72■■■□□ 2.19
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM47Q96LD4 638 aa28.72■■■□□ 2.19
SMKR1-201ENST00000462322 SOX10P56693 466 aa28.71■■■□□ 2.19
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