RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa20.29■□□□□ 0.84
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SPNS1-202ENST00000323081 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CTR9Q6PD62 1173 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 FGRP09769 529 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 EVX2Q03828 476 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 ISM2Q6H9L7 571 aa20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 JAG2Q9Y219 1238 aa20.29■□□□□ 0.84
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SPNS1-202ENST00000323081 USP17L21D6R901 530 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 NR5A1Q13285 461 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 PPP2R5BQ15173 497 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 LAMB1P07942 1786 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 UBR3Q6ZT12 1888 aa20.28■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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SPNS1-202ENST00000323081 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 IQCA1Q86XH1 822 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 MYH6P13533 1939 aa20.27■□□□□ 0.84
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SPNS1-202ENST00000323081 ARID5BQ14865 1188 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 CNBD1Q8NA66 436 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.27■□□□□ 0.84
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.26■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 LONRF3Q496Y0 759 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 SPECC1Q5M775 1068 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 OXER1Q8TDS5 423 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 SMTNL1A8MU46 457 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 TPM4P67936 248 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 CNNM3Q8NE01 707 aa20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.25■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 XBP1P17861 261 aa20.24■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 CABP5Q9NP86 173 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.24■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 PTPREP23469 700 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 GRIN1Q05586 938 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 PKN1Q16512 942 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.24■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 ADRA2BP18089 450 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 FUT2Q10981 343 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 TROAPQ12815 778 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 IFNKQ9P0W0 207 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 CALM2P0DP24 149 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 CALM3P0DP25 149 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 HSPA1LP34931 641 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 SHISA4Q96DD7 197 aa20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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SPNS1-202ENST00000323081 CYP2D6P10635 497 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 SKILP12757 684 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 ORC4O43929 436 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 NMT2O60551 498 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 GYS1P13807 737 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 XDHP47989 1333 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS1-202ENST00000323081 DDAH1O94760 285 aa20.21■□□□□ 0.83
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