RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SBK1Q52WX2 424 aa26.73■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.73■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CXCL11O14625 94 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SNAPC2Q13487 334 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CCL15Q16663 113 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.72■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 LBX1P52954 281 aa26.71■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.71■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 VPS53Q5VIR6 699 aa26.71■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.71■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 PTPRFP10586 1907 aa26.7■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.7■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.7■■□□□ 1.87
SYF2-201ENST00000236273 CETPP11597 493 aa26.69■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 GINM1Q9NU53 330 aa26.69■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.69■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 USP17L5A8MUK1 530 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 BTBD19C9JJ37 291 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D8O95759 1140 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 GH2P01242 217 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ASNSP08243 561 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 GUCY1A2P33402 732 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.68■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 APPP05067 770 aa26.67■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 CDK8P49336 464 aa26.67■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 GPAT2Q6NUI2 795 aa26.67■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 WDR18Q9BV38 432 aa26.67■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 SWAP70Q9UH65 585 aa26.67■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 TRIM75PA6NK02 468 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ALDH1A1P00352 501 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 SPP2Q13103 211 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 IL25Q9H293 177 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.66■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ABCB5Q2M3G0 1257 aa26.65■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 MINDY4BA8MYZ0 360 aa26.65■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 TDO2P48775 406 aa26.65■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ALX1Q15699 326 aa26.65■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.65■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.64■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.64■■□□□ 1.86
SYF2-201ENST00000236273 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.64■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.64■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.64■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 AMOTL1Q8IY63 956 aa26.64■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.64■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.64■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 MYH8P13535 1937 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 HIP1O00291 1037 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 AKR1B1P15121 316 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 CRHR2Q13324 411 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 DGKZQ13574 1117 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 NAPBQ9H115 298 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa26.63■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 FGAP02671 866 aa26.62■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 CHMLP26374 656 aa26.62■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 SEPT2Q15019 361 aa26.62■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 AS3MTQ9HBK9 375 aa26.62■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.62■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 BACE1P56817 501 aa26.61■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.61■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.61■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 GPR25O00155 361 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 PDHXO00330 501 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 RASA1P20936 1047 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 PPARAQ07869 468 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 ACER1Q8TDN7 264 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 CABP5Q9NP86 173 aa26.6■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 HMGCS2P54868 508 aa26.59■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 MTMR2Q13614 643 aa26.59■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 TREML2Q5T2D2 321 aa26.59■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 CCDC17Q96LX7 622 aa26.59■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.59■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 USP17L10C9JJH3 530 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 GADL1Q6ZQY3 521 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.58■■□□□ 1.85
SYF2-201ENST00000236273 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms