RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	SFB3	P38810	929 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.14	□□□□□ -0.63	RIP-Chip
DDR2	YOL052C-A	YNL034W	P53963	612 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YNL018C	P53976	612 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	PIR3	Q03180	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ARP9	Q05123	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	HMG2	P12684	1045 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	GID7	P25569	745 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SLD2	P34252	453 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ATG12	P38316	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	UFE1	P41834	346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	BST1	P43571	1029 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YMR160W	Q03823	816 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	BSP1	Q06604	576 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SWC7	Q06707	132 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YLR012C	Q07927	99 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YPQ1	Q12010	308 aa		11.13	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	AMS1	P22855	1083 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	NDI1	P32340	513 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ISF1	P32488	338 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SMI1	P32566	505 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SRP101	P32916	621 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ETR1	P38071	380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ADI1	Q03677	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	AFI1	Q99222	893 aa		11.12	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	PEX1	P24004	1043 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ELO3	P40319	345 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	RRN7	P40992	514 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YET3	Q07451	203 aa		11.11	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	APE1	P14904	514 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	MET22	P32179	357 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SGE1	P33335	543 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	ADD66	P36040	267 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YHL041W	P38730	149 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	KTR7	P40504	517 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YML119W	Q03208	357 aa		11.1	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	COX5A	P00424	153 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YCL068C	P25593	260 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	KTR4	P38131	464 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	LSB6	P42951	607 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	COQ6	P53318	479 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	SIW14	P53965	281 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	CDC14	Q00684	551 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	PGC1	Q08959	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	LDB17	Q12342	491 aa		11.09	□□□□□ -0.63
DDR2	YOL052C-A	PEX34	P25584	144 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	TDA10	P42938	290 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	DOS2	P54858	310 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	RSC4	Q02206	625 aa		11.08	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	INO1	P11986	533 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	KAR9	P32526	644 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YFL012W	P43580	148 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	GND2	P53319	492 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	TOF2	Q02208	771 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YPL014W	Q02606	381 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	LDB18	Q07887	179 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YLR053C	Q12026	108 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	OCA6	Q12454	224 aa		11.07	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	PPH22	P23595	377 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	RDH54	P38086	958 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YBR032W	P38223	100 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	PEX28	P38848	579 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YJL107C	P42947	387 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	RSC2	Q06488	889 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YOR387C	Q08910	206 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	SLP1	Q12232	587 aa		11.06	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	COQ8	P27697	501 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	DEP1	P31385	405 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	BEM3	P32873	1128 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	TGL4	P36165	910 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	MRPL40	P36534	297 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	YSW1	P38280	609 aa		11.05	□□□□□ -0.64
DDR2	YOL052C-A	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 67.7 ms