RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	GPI10	P30777	616 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	PLC1	P32383	869 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	KAR9	P32526	644 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	AIM26	P32858	118 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	APM3	P38153	483 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	DUN1	P39009	513 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ELO3	P40319	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ATM1	P40416	690 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	INA22	P40576	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YNL320W	P42840	284 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	SAE2	P46946	345 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RSM26	P47141	266 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RTA1	P53047	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YTP1	P53584	459 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
FMP46	YKR049C	NMA111	P53920	997 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	FAP1	P53971	965 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YHM2	Q04013	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ARP9	Q05123	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	IMA2	Q08295	589 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MPC54	Q08550	464 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	HOS1	Q12214	470 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	AFI1	Q99222	893 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MIH1	P23748	554 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MGT1	P26188	188 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	UTR2	P32623	467 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	SRP101	P32916	621 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	SWE1	P32944	819 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RPC37	P36121	282 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MRPL40	P36534	297 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	SCC4	P40090	624 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	OSW5	P40219	148 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	UBP7	P40453	1071 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	CHS6	P40955	746 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RMD8	P43620	662 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RSM7	P47150	247 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	FLC3	P53121	802 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YNR063W	P53749	607 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	IPI3	P53877	555 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	COG6	P53959	839 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	IRC10	Q08118	586 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	TRE2	Q08693	809 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	PGC1	Q08959	321 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ACM1	Q08981	209 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	COX5A	P00424	153 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ADH4	P10127	382 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	HEM15	P16622	393 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MRPL8	P22353	238 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MRM1	P25270	412 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YME1	P32795	747 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	LIP5	P32875	414 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ARP1	P38696	384 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ERR3	P42222	437 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	MIC19	P43594	170 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	AIM23	P47015	356 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YJR039W	P47107	1121 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	TAH11	P47112	604 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	AMA1	P50082	593 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	AIM14	P53109	570 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	ORC3	P54790	616 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	DOS2	P54858	310 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	CDC14	Q00684	551 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	RSC4	Q02206	625 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	LDB18	Q07887	179 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	OCA6	Q12454	224 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	PEX11	Q12462	236 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FMP46	YKR049C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.33	□□□□□ -1.72

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