RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	YFL034W	P43564	1073 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	DIE2	P50076	525 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MPS1	P54199	764 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	UBX4	P54730	416 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	FMN1	Q03778	218 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	BNA7	Q04066	261 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	FMP16	Q12497	93 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CYB2	P00175	591 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	URA3	P03962	267 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	RAP1	P11938	827 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ATP12	P22135	325 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	KIP2	P28743	706 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	HEM3	P28789	327 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	SRP101	P32916	621 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	KTR2	P33550	425 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	TAF14	P35189	244 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	NUP133	P36161	1157 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	BAP2	P38084	609 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	GOS1	P38736	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	SPC97	P38863	823 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MTW1	P39731	289 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MAM33	P40513	266 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CNN1	P43618	361 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	NAS6	P50086	228 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MDM1	Q01846	1127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YDR476C	Q03362	224 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PEX10	Q05568	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CDA1	Q06702	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
SKG6	YHR149C	ATG31	Q12421	196 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	GRX6	Q12438	231 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YOS9	Q99220	542 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CKA2	P19454	339 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	VPS33	P20795	691 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	DGR2	P32330	852 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CYM1	P32898	989 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PEX6	P33760	1030 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YPK3	P38070	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	KTR4	P38131	464 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	EMP65	P40085	556 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	RTS2	P40962	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	GLG2	P47011	380 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ASE1	P50275	885 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PET117	Q02771	107 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	SHR3	Q02774	210 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MUK1	Q02866	612 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PHM6	Q05637	104 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	COQ9	Q05779	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	VTA1	Q06263	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MLH2	Q07980	695 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YAP7	Q08182	245 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	SSP2	Q08646	371 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	MCD1	Q12158	566 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ATG34	Q12292	412 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ERG12	P07277	443 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ERG11	P10614	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	EXO70	P19658	623 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PMT2	P31382	759 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	SEO1	P39709	593 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PSF2	P40359	213 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	FET5	P43561	622 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YJR098C	P47139	656 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YGR111W	P53265	400 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CAF40	P53829	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	TBF1	Q02457	562 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	RMI1	Q02685	241 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	SSY1	Q03770	852 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CRN1	Q06440	651 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	CSC1	Q06538	782 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	PSR2	Q07949	397 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	FEX1	Q08913	375 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	ERP4	Q12450	207 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	AI2	P03876	854 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SKG6	YHR149C	STE12	P13574	688 aa		4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms