RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D12	O60347	775 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	GNAI3	P08754	354 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	MCAM	P43121	646 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA5	Q8NB90	893 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PRO3102	Q9H379	93 aa		14.76	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SGPL1	O95470	568 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM27	P14373	513 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	IRF5	Q13568	498 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGCS2	P54868	508 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SPP2	Q13103	211 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB118	Q96PH6	123 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	RAI14	Q9P0K7	980 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX11	Q8IYF3	940 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	CAP2	P40123	477 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	GSTO1	P78417	241 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	JAG1	P78504	1218 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	GORAB	Q5T7V8	394 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC18	Q9H819	358 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PNMA3	Q9UL41	463 aa		14.72	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX10	O60683	326 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	BCAR3	O75815	825 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	GNAI2	P04899	355 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	LDHC	P07864	332 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	COA7	Q96BR5	231 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRK	Q9NRH2	765 aa		14.71	□□□□□ -0.05
TTLL3-233	ENST00000602338	COL6A3	P12111	3177 aa		14.71	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	MYH1	P12882	1939 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM32	Q13049	653 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	14.7	□□□□□ -0.06	2e-7	■□□□□ 9.5
TTLL3-233	ENST00000602338	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		14.7	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	FLT1	P17948	1338 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	USP17L5	A8MUK1	530 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	MTMR2	Q13614	643 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	GJD2	Q9UKL4	321 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		14.69	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	EVI5	O60447	810 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	HMGCR	P04035	888 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	POLA2	Q14181	598 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TNNI3K	Q59H18	835 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		14.68	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	GDF11	O95390	407 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	BACE1	P56817	501 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIB2	Q92519	343 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR18	Q9BV38	432 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	CCER2	I3L3R5	266 aa		14.66	□□□□□ -0.06
TTLL3-233	ENST00000602338	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06

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