RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 GGA1Q9UJY5 639 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 PASKQ96RG2 1323 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 RIC1Q4ADV7 1423 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CDKL5O76039 1030 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 MSNP26038 577 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 AKNAD1Q5T1N1 836 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF34Q8IZ26 560 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 C7orf43Q8WVR3 580 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF26B4DH59 902 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 RAD17O75943 681 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 DGKZQ13574 1117 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 TTLL7Q6ZT98 887 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF15Q8N660 670 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D7Q9P0N9 293 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO1BO43795 1136 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 VCAM1P19320 739 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 RRM1P23921 792 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ATICP31939 592 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 EPS15P42566 896 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 FKBP1BP68106 108 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 GINM1Q9NU53 330 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR12Q9ULL5 1215 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 TJP1Q07157 1748 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ATP2B4P23634 1241 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 SMARCA1P28370 1054 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF132P52740 706 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 RPS8P62241 208 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 TERF2Q15554 542 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMC3Q5W041 872 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4F22Q6NT55 531 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 RGMBQ6NW40 437 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMC9Q7Z3E5 817 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 MICALL2Q8IY33 904 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM11Q96F44 468 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 BICD1Q96G01 975 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC34Q96HJ3 373 aa5.3□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 OGFRQ9NZT2 677 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 POTECB2RU33 542 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 RIMBP2O15034 1052 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 NTSR2O95665 410 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 USP48Q86UV5 1035 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 DHRS1Q96LJ7 313 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 CHMP5Q9NZZ3 219 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 MYO3BQ8WXR4 1341 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 UFL1O94874 794 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 FOSL1P15407 271 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF24P17028 368 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 SREBF2Q12772 1141 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 SCYL1Q96KG9 808 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC45AQ9H3U1 944 aa5.29□□□□□ -1.56
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RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC4O15439 1325 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 MMEP08473 750 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 POTEIP0CG38 1075 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 POTEJP0CG39 1038 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 IL4RP24394 825 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 RWDD2BP57060 319 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 DPH6Q7L8W6 267 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 SLF2Q8IX21 1173 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGGTB-213ENST00000496055 GCC1Q96CN9 775 aa5.29□□□□□ -1.56
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