RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 BCAR3O75815 825 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.518e-8■■■□□ 18.4
NELFE-212ENST00000492539 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 RAI14Q9P0K7 980 aa24.51■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 FLT3LGP49771 235 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 IRF5Q13568 498 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 TREML2Q5T2D2 321 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.5■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 ADCY3O60266 1144 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 PNMA3Q9UL41 463 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa24.49■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 GPR108Q9NPR9 543 aa24.48■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 CAP2P40123 477 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 SPP2Q13103 211 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 POLA2Q14181 598 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 TEX11Q8IYF3 940 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 INHAP05111 366 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 ELNP15502 786 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 DPF3Q92784 378 aa24.46■■□□□ 1.51
NELFE-212ENST00000492539 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 SGPL1O95470 568 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 TNNI3KQ59H18 835 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 HTATIP2Q9BUP3 242 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.45■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 USP17L5A8MUK1 530 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 HMGCS2P54868 508 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 SSH3Q8TE77 659 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 COA7Q96BR5 231 aa24.44■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
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NELFE-212ENST00000492539 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 CAPN2P17655 700 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
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NELFE-212ENST00000492539 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 SNRKQ9NRH2 765 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 SZT2Q5T011 3432 aa24.43■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 PLXNB2O15031 1838 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 IGSF3O75054 1194 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 BAG3O95817 575 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 ATP8B2P98198 1209 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 PLCG2P16885 1265 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 WDR18Q9BV38 432 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 ALPK3Q96L96 1907 aa24.41■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 FLT1P17948 1338 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 DNAJC18Q9H819 358 aa24.4■■□□□ 1.5
NELFE-212ENST00000492539 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa24.39■■□□□ 1.49
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NELFE-212ENST00000492539 DEFB118Q96PH6 123 aa24.39■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.39■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 PRO3102Q9H379 93 aa24.39■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 MYH1P12882 1939 aa24.39■■□□□ 1.49
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NELFE-212ENST00000492539 JAG1P78504 1218 aa24.38■■□□□ 1.49
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NELFE-212ENST00000492539 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.38■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 ZAP70P43403 619 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 BACE1P56817 501 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 MTMR2Q13614 643 aa24.37■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
NELFE-212ENST00000492539 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.37■■□□□ 1.49
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