RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.98□□□□□ -0.97
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USP4-211ENST00000485450 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
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USP4-211ENST00000485450 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.98□□□□□ -0.97
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USP4-211ENST00000485450 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
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USP4-211ENST00000485450 MAP9Q49MG5 647 aa8.94□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.94□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 PACS2Q86VP3 889 aa8.94□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 MICALL2Q8IY33 904 aa8.94□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
USP4-211ENST00000485450 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.94□□□□□ -0.98
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