RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ORAI2Q96SN7 254 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PYCARDQ9ULZ3 195 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF202O95125 648 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GJC1P36383 396 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GCKRQ14397 625 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CROCCP2Q86T23 111 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IFT74Q96LB3 600 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ANTXR1Q9H6X2 564 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MAP7Q14244 749 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf74Q6P047 294 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf50Q9HD87 102 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CHD1O14646 1710 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 C6orf229H3BNL8 230 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 STAP2Q9UGK3 403 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 BICDL2A1A5D9 508 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SETSIPP0DME0 302 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 KRT9P35527 623 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R2P41236 205 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TIMM10P62072 90 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PLCB3Q01970 1234 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CALCOCO2Q13137 446 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 VCX3BQ9H321 246 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF174Q15697 407 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 POTEDQ86YR6 584 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CCT6BQ92526 530 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ABCC3O15438 1527 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CIB2O75838 187 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ADAMTS2O95450 1211 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CALML3P27482 149 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CABS1Q96KC9 395 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 INF2Q27J81 1249 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SLF1Q9BQI6 1058 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 BEND3Q5T5X7 828 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 STMN2Q93045 179 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NAPAP54920 295 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CLUL1Q15846 466 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 SIRT2Q8IXJ6 389 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MIPOL1Q8TD10 442 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TCHPQ9BT92 498 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-202ENST00000400053 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 GNAT2P19087 354 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PCK1P35558 622 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 KRT2P35908 639 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DMTNQ08495 405 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 CYP26C1Q6V0L0 522 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 12.4
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DESI2Q9BSY9 194 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PALD1Q9ULE6 856 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MAP2K2P36507 400 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NLRP12P59046 1061 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 DTHD1Q6ZMT9 781 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-202ENST00000400053 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
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