RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215956.9

SNU13-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNU13, Length 1,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13-201ENST00000215956 MFSD14BQ5SR56 506 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNU13-201ENST00000215956 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.58□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.58□□□□□ -0.08
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SNU13-201ENST00000215956 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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SNU13-201ENST00000215956 NECTIN1Q15223 517 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNU13-201ENST00000215956 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.53□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 IL25Q9H293 177 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNU13-201ENST00000215956 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.53□□□□□ -0.08
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SNU13-201ENST00000215956 APPBP2Q92624 585 aa14.52□□□□□ -0.08
SNU13-201ENST00000215956 SEMA3EO15041 775 aa14.52□□□□□ -0.09
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SNU13-201ENST00000215956 CACNB3P54284 484 aa14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 PTH1RQ03431 593 aa14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 PPIL2Q13356 520 aa14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.52□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 CTGFP29279 349 aa14.51□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 MCAMP43121 646 aa14.51□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 MAP3K12Q12852 859 aa14.51□□□□□ -0.09
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SNU13-201ENST00000215956 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 C17orf99Q6UX52 265 aa14.51□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.51□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 SRRDQ9UH36 339 aa14.51□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 PALD1Q9ULE6 856 aa14.51□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 PSMC4P43686 418 aa14.5□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 PHKA1P46020 1223 aa14.5□□□□□ -0.09
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SNU13-201ENST00000215956 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.5□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.5□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.49□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 SLC27A2O14975 620 aa14.49□□□□□ -0.09
SNU13-201ENST00000215956 OSBPP22059 807 aa14.49□□□□□ -0.09
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SNU13-201ENST00000215956 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
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SNU13-201ENST00000215956 VPS53Q5VIR6 699 aa14.49□□□□□ -0.09
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