RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ehmt1Q5DW34 1296 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Calhm4Q8CE93 315 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Frmpd4A2AFR3 1320 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acsl1P41216 699 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mansc4Q3UU94 337 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acot3Q9QYR7 432 aa23.56■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plcg1Q62077 1302 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arl14Q3SXC5 192 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Calr4Q3TQS0 420 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Qrich1Q3UA37 777 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Syne4Q8CII8 388 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Inpp5bQ8K337 993 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Klrc1Q9Z202 244 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm44503E9PYU5 387 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ThbdP15306 577 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hspa8P63017 646 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttll4Q80UG8 1193 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AidaQ8C4Q6 305 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnaaf4Q8R368 420 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Adam1bQ8R534 806 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trex1Q91XB0 314 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mkrn1Q9QXP6 481 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccnd3P30282 292 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aak1Q3UHJ0 959 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Brip1Q5SXJ3 1174 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sv2cQ69ZS6 727 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp33Q8R5K2 909 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Q9D2X8 372 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MsraQ9D6Y7 233 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Brca1P48754 1812 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dennd3A2RT67 1274 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 NapbP28663 298 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sema3eP70275 775 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nbr1P97432 988 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf667Q2TL60 609 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scnn1aQ61180 699 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PpatQ8CIH9 517 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gimap3Q99MI6 301 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ano3A2AHL1 981 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abl1P00520 1123 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr118Q7TRJ6 321 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cog6Q8R3I3 657 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cdk8Q8R3L8 464 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MyocdQ8VIM5 935 aa23.51■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mbtps2Q8CHX6 515 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FAM186AQ9D9R9 1790 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rfpl4bJ3QPR6 266 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nek11Q8C0Q4 628 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Alx1Q8C8B0 326 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mms22lB1AUR6 1238 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prr7Q3V0I2 269 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ndufv1Q91YT0 464 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bap1Q99PU7 728 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nudt12Q9DCN1 462 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp31E9Q6Y8 1344 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pus7B7ZNL8 666 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 FlgP11088 336 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gba2Q69ZF3 918 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acap3Q6NXL5 833 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Scfd2Q8BTY8 684 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RragcQ99K70 398 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hap1O35668 628 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eps15P42567 897 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MyrflQ3UN70 904 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dpp8Q80YA7 892 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ttc12Q8BW49 704 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Styxl1Q9DAR2 321 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Efcc1Q9JJF6 558 aa23.47■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SynrgQ5SV85 1306 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Med23Q80YQ2 1367 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sept2P42208 361 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dcaf15Q6PFH3 600 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp341Q6PGC9 846 aa23.46■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 A0A1W2P6Q8 802 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 A0A1W2P7Z8 802 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm9046A0A1W2P855 802 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnni2P13412 182 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MecomP14404 1042 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mybl2P48972 704 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ercc3P49135 783 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Podnl1Q6P3Y9 559 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 H2-Q4Q8HWB2 354 aa23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Eaf2Q91ZD6 262 aa23.44■■□□□ 1.34
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