RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031377.8

Scarb2-201, Transcript of Lysosome membrane protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scarb2, Length 4,698 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Uba5Q8VE47 403 aa15.2■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pcdha7Q91Y13 937 aa15.2■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Eaf2Q91ZD6 262 aa15.2■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mst1rQ62190 1378 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kifc2O08672 792 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gucy1b3O54865 620 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ap5z1Q3U829 807 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Krt79Q8VED5 531 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 LpxnQ99N69 386 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 EhhadhQ9DBM2 718 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ccne2Q9Z238 404 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Setdb1O88974 1307 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 GnaqP21279 359 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pde6aP27664 859 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 TnrQ8BYI9 1358 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Plbd2Q3TCN2 594 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Als2cr12Q8BVM7 383 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gm28919A0A087WP35 240 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 1700013D24RikQ0P521 120 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Madcam1Q61826 405 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nlrp9bQ66X22 1003 aa15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Gpbp1Q6NXH3 473 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 A0A1Y7VML8 143 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 ByslO54825 436 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Terf1P70371 421 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ncoa7Q6DFV7 943 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dcaf5Q80T85 946 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cd209bQ8CJ91 325 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Naa15Q80UM3 865 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Lman1Q9D0F3 517 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ube3bQ9ES34 1070 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 GdaQ9R111 454 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Large1Q9Z1M7 756 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Flt4P35917 1363 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MthfslL7N466 203 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 CltaO08585 235 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Eme2Q56A04 373 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Prpf40bQ80W14 870 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dbndd1Q9CZ00 160 aa15.18■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 1700029H14RikE9PY36 240 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pald1P70261 859 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 CerkQ8K4Q7 531 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pcdha12Q91Y18 950 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ubxn1Q922Y1 297 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tacc2Q9JJG0 1149 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Eif6O55135 245 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Trap1aP19473 224 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 MmeQ61391 750 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Krit1Q6S5J6 736 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Trim52Q8CDV4 233 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ciao1Q99KN2 339 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Znf287Q9EQB9 759 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Znf541Q0GGX2 1363 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Samd15F6XZJ7 620 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Rad23aP54726 363 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hgh1Q8C3I8 393 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zbtb1Q91VL9 713 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cadps2Q8BYR5 1297 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 AdpgkQ8VDL4 496 aa15.17■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Nap1l2P51860 460 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Stx17Q9D0I4 301 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Golga5Q9QYE6 729 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hdac6Q9Z2V5 1149 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Med23Q80YQ2 1367 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Abca8aQ8K442 1620 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ublcp1Q8BGR9 318 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Dctpp1Q9QY93 170 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 DnmbpQ6TXD4 1580 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ddx41Q91VN6 622 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Haus2Q9CQS9 234 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Pard3Q99NH2 1333 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ces1aE9PYP1 563 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Sdad1Q80UZ2 687 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ift74Q8BKE9 600 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ppm1mQ8BU27 406 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Caps2Q8BUG5 550 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Mettl5Q8K1A0 209 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Calml3Q9D6P8 149 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Foxo3Q9WVH4 672 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Stk39Q9Z1W9 556 aa15.16■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Hecw2Q6I6G8 1578 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Apol7aB2RT54 418 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Irx2P81066 474 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Ints4Q8CIM8 964 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Abca9Q8K449 1623 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Klhl34A2AI76 644 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Stox1B2RQL2 990 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Zfp597E9Q6S0 419 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 Adcy3Q8VHH7 1145 aa15.15■□□□□ 0.02
Scarb2-201ENSMUST00000031377 A0A1W2P7S8 802 aa15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 8.9 ms