RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PnnO35691 725 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcsk7Q61139 770 aa22.85■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Anp32cQ64G17 123 aa22.85■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ftl1P29391 183 aa22.85■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rpusd2Q149F1 553 aa22.85■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aak1Q3UHJ0 959 aa22.85■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnn1Q9EQR3 537 aa22.85■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 A0A1Y7VML8 143 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pfkfb1P70266 471 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp50Q6P8X6 390 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdhb14Q6PB90 796 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tfcp2Q9ERA0 502 aa22.84■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stx1aO35526 288 aa22.83■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cfap157Q0VFX2 523 aa22.83■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc27a1Q60714 646 aa22.83■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pramel6Q810Y9 485 aa22.83■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tulp1Q9Z273 543 aa22.83■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Usp53P15975 1069 aa22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bach2P97303 839 aa22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cep131Q62036 1060 aa22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddrgk1Q80WW9 315 aa22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Peak1Q69Z38 1735 aa22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa22.83■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ano3A2AHL1 981 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atp2b1G5E829 1220 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptpn12P35831 775 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1700013D24RikQ0P521 120 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Traf3ip1Q149C2 625 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ndufv1Q91YT0 464 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mx2Q9WVP9 655 aa22.82■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Myo1bP46735 1107 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp4cP97470 307 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gja5Q01231 358 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam89aQ14BJ1 175 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Best3Q6H1V1 669 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apba2P98084 750 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp202Q8C879 641 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tob2Q9JM55 345 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igsf9bE9PZ19 1328 aa22.81■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Larp6Q8BN59 492 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8K2W9 541 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Jag1Q9QXX0 1218 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nup188Q6ZQH8 1759 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ambra1A2AH22 1300 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc6D3YZP9 469 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stx8O88983 236 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 IqcgQ80W32 419 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DlatQ8BMF4 642 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Triml1Q8BVP1 470 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lonrf3Q9D4H7 753 aa22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tekt3Q6X6Z7 490 aa22.79■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tsen34Q8BMZ5 316 aa22.79■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa22.79■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tspyl4Q8VD63 406 aa22.79■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp3a25O09158 503 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdhd1P59328 1117 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmtc2Q56A06 836 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AsnsQ61024 561 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp4x1Q6A152 507 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Haus7Q8BKT8 364 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rec8Q8C5S7 591 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Plcd3Q8K2J0 785 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hmgn5Q9JL35 406 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rgs17Q9QZB0 210 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ampd3O08739 766 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf667Q2TL60 609 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hvcn1Q3U2S8 269 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl2c1Q5SVL9 228 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Amer1Q7TS75 1132 aa22.78■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tpd52l1O54818 204 aa22.77■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gimap7Q8R379 293 aa22.77■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chrna2Q91X60 512 aa22.77■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hps4Q99KG7 671 aa22.77■■□□□ 1.24
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EzrP26040 586 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MycbpapQ5SUV2 932 aa22.77■■□□□ 1.23
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ankrd13aQ80UP5 588 aa22.77■■□□□ 1.23
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa22.77■■□□□ 1.23
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sned1Q70E20 1403 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.9 ms