RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	PRM1	P04553	51 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPIN3-231	ENST00000639895	MT1L	Q93083	61 aa		3.6	□□□□□ -1.83
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SPIN3-231	ENST00000639895	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.59	□□□□□ -1.84
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SPIN3-231	ENST00000639895	MT1E	P04732	61 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SPIN3-231	ENST00000639895	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SPIN3-231	ENST00000639895	KMT2D	O14686	5537 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SPIN3-231	ENST00000639895	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.41	□□□□□ -1.86
SPIN3-231	ENST00000639895	MT1M	Q8N339	61 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SPIN3-231	ENST00000639895	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SPIN3-231	ENST00000639895	USH2A	O75445	5202 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR2E	P22531	72 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR2B	P35325	72 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR2A	P35326	72 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPIN3-231	ENST00000639895	MT1A	P04731	61 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPIN3-231	ENST00000639895	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPIN3-231	ENST00000639895	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPIN3-231	ENST00000639895	SPRR2D	P22532	72 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPIN3-231	ENST00000639895	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SPIN3-231	ENST00000639895	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.06	□□□□□ -1.92
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.05	□□□□□ -1.92
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.02	□□□□□ -1.93
SPIN3-231	ENST00000639895	MT3	P25713	68 aa		2.99	□□□□□ -1.93
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SPIN3-231	ENST00000639895	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE1D	Q5T752	114 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-9	P26371	169 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SPIN3-231	ENST00000639895	MT4	P47944	62 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SPIN3-231	ENST00000639895	MDN1	Q9NU22	5596 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.58	□□□□□ -2
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.51	□□□□□ -2.01
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SPIN3-231	ENST00000639895	NEB	P20929	6669 aa		2.4	□□□□□ -2.03
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.32	□□□□□ -2.04
SPIN3-231	ENST00000639895	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.19	□□□□□ -2.06
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SPIN3-231	ENST00000639895	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.16	□□□□□ -2.06
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.14	□□□□□ -2.07
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.12	□□□□□ -2.07
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.12	□□□□□ -2.07
SPIN3-231	ENST00000639895	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.08	□□□□□ -2.08
SPIN3-231	ENST00000639895	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.06	□□□□□ -2.08
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.88	□□□□□ -2.11
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		1.85	□□□□□ -2.11
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	1.83	□□□□□ -2.12
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		1.83	□□□□□ -2.12
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.79	□□□□□ -2.12
SPIN3-231	ENST00000639895	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		1.78	□□□□□ -2.12
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-8	O75690	187 aa		1.74	□□□□□ -2.13
SPIN3-231	ENST00000639895	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	1.63	□□□□□ -2.15
SPIN3-231	ENST00000639895	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.63	□□□□□ -2.15
SPIN3-231	ENST00000639895	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.56	□□□□□ -2.16
SPIN3-231	ENST00000639895	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.44	□□□□□ -2.18
SPIN3-231	ENST00000639895	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.03	□□□□□ -2.25

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