RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.09□□□□□ -1.75
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.08□□□□□ -1.76
SLC35E2B-205ENST00000617444 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.07□□□□□ -1.76
SLC35E2B-205ENST00000617444 HERC2O95714 4834 aa4.05□□□□□ -1.76
SLC35E2B-205ENST00000617444 LRP2P98164 4655 aa3.97□□□□□ -1.77
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.93□□□□□ -1.78
SLC35E2B-205ENST00000617444 MT1AP04731 61 aa3.92□□□□□ -1.78
SLC35E2B-205ENST00000617444 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.9□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.89□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 LCE1CQ5T751 118 aa3.89□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 LCE1EQ5T753 118 aa3.89□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 LCE1FQ5T754 118 aa3.89□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.89□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.88□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.85□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.85□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.85□□□□□ -1.79
SLC35E2B-205ENST00000617444 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.83□□□□□ -1.8
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.81□□□□□ -1.8
SLC35E2B-205ENST00000617444 MUC17Q685J3 4493 aa3.8□□□□□ -1.8
SLC35E2B-205ENST00000617444 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.71□□□□□ -1.82
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.7□□□□□ -1.82
SLC35E2B-205ENST00000617444 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.7□□□□□ -1.82
SLC35E2B-205ENST00000617444 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
SLC35E2B-205ENST00000617444 LCE4AQ5TA78 99 aa3.66□□□□□ -1.82
SLC35E2B-205ENST00000617444 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.65□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 MUC2Q02817 5179 aa3.62□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.62□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.61□□□□□ -1.83
SLC35E2B-205ENST00000617444 RNF213Q63HN8 5207 aa3.56□□□□□ -1.84
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.49□□□□□ -1.85
SLC35E2B-205ENST00000617444 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.47□□□□□ -1.85
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.46□□□□□ -1.86
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.46□□□□□ -1.86
SLC35E2B-205ENST00000617444 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SLC35E2B-205ENST00000617444 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SLC35E2B-205ENST00000617444 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
SLC35E2B-205ENST00000617444 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.24□□□□□ -1.89
SLC35E2B-205ENST00000617444 USH2AO75445 5202 aa3.22□□□□□ -1.89
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.14□□□□□ -1.91
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.1□□□□□ -1.91
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.03□□□□□ -1.92
SLC35E2B-205ENST00000617444 KMT2DO14686 5537 aa3.02□□□□□ -1.93
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3□□□□□ -1.93
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.99□□□□□ -1.93
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.99□□□□□ -1.93
SLC35E2B-205ENST00000617444 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.98□□□□□ -1.93
SLC35E2B-205ENST00000617444 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.94□□□□□ -1.94
SLC35E2B-205ENST00000617444 NEBP20929 6669 aa2.92□□□□□ -1.94
SLC35E2B-205ENST00000617444 MDN1Q9NU22 5596 aa2.86□□□□□ -1.95
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-9P26371 169 aa2.82□□□□□ -1.96
SLC35E2B-205ENST00000617444 SSPOA2VEC9 5147 aa2.73□□□□□ -1.97
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.7□□□□□ -1.98
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
SLC35E2B-205ENST00000617444 MUC5ACP98088 5654 aa2.42□□□□□ -2.02
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.38□□□□□ -2.03
SLC35E2B-205ENST00000617444 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.36□□□□□ -2.03
SLC35E2B-205ENST00000617444 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.32□□□□□ -2.04
SLC35E2B-205ENST00000617444 PHGR1C9JFL3 82 aa2.32□□□□□ -2.04
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-8O75690 187 aa2.2□□□□□ -2.06
SLC35E2B-205ENST00000617444 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.09□□□□□ -2.08
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.97□□□□□ -2.09
SLC35E2B-205ENST00000617444 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.85□□□□□ -2.11
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.83□□□□□ -2.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.83□□□□□ -2.12
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.69□□□□□ -2.14
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.65□□□□□ -2.14
SLC35E2B-205ENST00000617444 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.49□□□□□ -2.17
SLC35E2B-205ENST00000617444 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.23□□□□□ -2.21
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