RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACSS3-208	ENST00000616449	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.34	□□□□□ -1.72
ACSS3-208	ENST00000616449	MT1L	Q93083	61 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ACSS3-208	ENST00000616449	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACSS3-208	ENST00000616449	MT1E	P04732	61 aa		4.3	□□□□□ -1.72
ACSS3-208	ENST00000616449	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACSS3-208	ENST00000616449	MT1M	Q8N339	61 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ACSS3-208	ENST00000616449	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRR2E	P22531	72 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRR2B	P35325	72 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRR2A	P35326	72 aa		3.96	□□□□□ -1.78
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.94	□□□□□ -1.78
ACSS3-208	ENST00000616449	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.91	□□□□□ -1.78
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.81	□□□□□ -1.8
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRR2D	P22532	72 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ACSS3-208	ENST00000616449	PRM1	P04553	51 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.62	□□□□□ -1.83
ACSS3-208	ENST00000616449	MT1A	P04731	61 aa		3.6	□□□□□ -1.83
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ACSS3-208	ENST00000616449	MT4	P47944	62 aa		3.53	□□□□□ -1.84
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.48	□□□□□ -1.85
ACSS3-208	ENST00000616449	MT3	P25713	68 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ACSS3-208	ENST00000616449	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.35	□□□□□ -1.87
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.28	□□□□□ -1.88
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.25	□□□□□ -1.89
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.24	□□□□□ -1.89
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.19	□□□□□ -1.9
ACSS3-208	ENST00000616449	NEB	P20929	6669 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ACSS3-208	ENST00000616449	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ACSS3-208	ENST00000616449	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.88	□□□□□ -1.95
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.85	□□□□□ -1.95
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.58	□□□□□ -2
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.58	□□□□□ -2
ACSS3-208	ENST00000616449	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.55	□□□□□ -2
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ACSS3-208	ENST00000616449	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.46	□□□□□ -2.02
ACSS3-208	ENST00000616449	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.45	□□□□□ -2.02
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.43	□□□□□ -2.02
ACSS3-208	ENST00000616449	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.4	□□□□□ -2.02
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.31	□□□□□ -2.04
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.19	□□□□□ -2.06
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.09	□□□□□ -2.08
ACSS3-208	ENST00000616449	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.99	□□□□□ -2.09
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		1.98	□□□□□ -2.09
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.98	□□□□□ -2.09
ACSS3-208	ENST00000616449	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.87	□□□□□ -2.11
ACSS3-208	ENST00000616449	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.73	□□□□□ -2.13
ACSS3-208	ENST00000616449	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.13	□□□□□ -2.23

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.4 ms