RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-9P26371 169 aa4.97□□□□□ -1.61
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRR2EP22531 72 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRR2BP35325 72 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRR2AP35326 72 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE3AQ5TA76 89 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1-209ENST00000607882 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP10-12P60413 245 aa4.86□□□□□ -1.63
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.8□□□□□ -1.64
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRR2DP22532 72 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP12-3P60328 96 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-209ENST00000607882 MT1EP04732 61 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE3BQ5TA77 95 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-209ENST00000607882 MT1LQ93083 61 aa4.41□□□□□ -1.7
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.4□□□□□ -1.7
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGEF1-209ENST00000607882 MT1GP13640 62 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-209ENST00000607882 MT1MQ8N339 61 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE1EQ5T753 118 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-209ENST00000607882 MT4P47944 62 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE1FQ5T754 118 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-209ENST00000607882 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE1DQ5T752 114 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-209ENST00000607882 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE4AQ5TA78 99 aa4.01□□□□□ -1.77
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1-209ENST00000607882 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1-209ENST00000607882 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP12-4P60329 112 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGEF1-209ENST00000607882 MT1AP04731 61 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.69□□□□□ -1.82
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.6□□□□□ -1.83
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.59□□□□□ -1.83
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.51□□□□□ -1.85
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.49□□□□□ -1.85
RABGEF1-209ENST00000607882 PRM1P04553 51 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGEF1-209ENST00000607882 MT3P25713 68 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-8O75690 187 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC5ACP98088 5654 aa3.26□□□□□ -1.89
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGEF1-209ENST00000607882 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.82□□□□□ -1.96
RABGEF1-209ENST00000607882 LCE1CQ5T751 118 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.45□□□□□ -2.02
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.43□□□□□ -2.02
RABGEF1-209ENST00000607882 PHGR1C9JFL3 82 aa2.23□□□□□ -2.05
RABGEF1-209ENST00000607882 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.4 ms