RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 K7ERS5 55 aa4.01□□□□□ -1.77
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.01□□□□□ -1.77
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TNP1P09430 55 aa3.98□□□□□ -1.77
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MDN1Q9NU22 5596 aa3.97□□□□□ -1.77
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.96□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE3AQ5TA76 89 aa3.95□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.94□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.93□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR2EP22531 72 aa3.91□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR2BP35325 72 aa3.91□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR2AP35326 72 aa3.91□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.9□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1EP04732 61 aa3.88□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.87□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BRK1Q8WUW1 75 aa3.87□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ROMO1P60602 79 aa3.86□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR2DP22532 72 aa3.77□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP12-3P60328 96 aa3.77□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.76□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A0A0MQY5 61 aa3.75□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1LQ93083 61 aa3.75□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.72□□□□□ -1.81
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1GP13640 62 aa3.7□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.69□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.69□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1MQ8N339 61 aa3.67□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.67□□□□□ -1.82
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PMAIP1Q13794 54 aa3.65□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PP632Q6XCG6 107 aa3.61□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.59□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.59□□□□□ -1.83
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRO0628Q9UI54 55 aa3.58□□□□□ -1.84
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRAC1Q96KF2 57 aa3.54□□□□□ -1.84
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.5□□□□□ -1.85
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.37□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.35□□□□□ -1.87
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.32□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT4P47944 62 aa3.31□□□□□ -1.88
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT3P25713 68 aa3.25□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.24□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.19□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MT1AP04731 61 aa3.17□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP12-4P60329 112 aa3.14□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.13□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.09□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.09□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NDUFAF8A1L188 74 aa3.01□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.99□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE1FQ5T754 118 aa2.98□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE1EQ5T753 118 aa2.95□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.95□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.93□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.91□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
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GMDS-AS1-216ENST00000607519 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.76□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.74□□□□□ -1.97
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-8O75690 187 aa2.7□□□□□ -1.98
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUC5ACP98088 5654 aa2.62□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.62□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.59□□□□□ -1.99
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.56□□□□□ -2
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.47□□□□□ -2.01
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.42□□□□□ -2.02
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LCE1CQ5T751 118 aa2.37□□□□□ -2.03
GMDS-AS1-216ENST00000607519 INE1O15225 51 aa2.18□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.09□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRM1P04553 51 aa2.03□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PHGR1C9JFL3 82 aa1.84□□□□□ -2.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.71□□□□□ -2.14
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.23□□□□□ -2.21
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.22□□□□□ -2.21
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