RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP12-2P59991 146 aa5.31□□□□□ -1.56
HCG18-241ENST00000602290 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.29□□□□□ -1.56
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.24□□□□□ -1.57
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.24□□□□□ -1.57
HCG18-241ENST00000602290 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.24□□□□□ -1.57
HCG18-241ENST00000602290 PP632Q6XCG6 107 aa5.23□□□□□ -1.57
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.2□□□□□ -1.58
HCG18-241ENST00000602290 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.18□□□□□ -1.58
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.16□□□□□ -1.58
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.12□□□□□ -1.59
HCG18-241ENST00000602290 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.11□□□□□ -1.59
HCG18-241ENST00000602290 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.08□□□□□ -1.6
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.06□□□□□ -1.6
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.03□□□□□ -1.6
HCG18-241ENST00000602290 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.02□□□□□ -1.61
HCG18-241ENST00000602290 LCE1DQ5T752 114 aa5.01□□□□□ -1.61
HCG18-241ENST00000602290 INE1O15225 51 aa4.98□□□□□ -1.61
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.97□□□□□ -1.61
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.91□□□□□ -1.62
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.91□□□□□ -1.62
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.89□□□□□ -1.63
HCG18-241ENST00000602290 R4GN34 69 aa4.86□□□□□ -1.63
HCG18-241ENST00000602290 MT1XP80297 61 aa4.84□□□□□ -1.63
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.79□□□□□ -1.64
HCG18-241ENST00000602290 MT4P47944 62 aa4.78□□□□□ -1.64
HCG18-241ENST00000602290 LCE4AQ5TA78 99 aa4.74□□□□□ -1.65
HCG18-241ENST00000602290 TNP1P09430 55 aa4.7□□□□□ -1.66
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.66□□□□□ -1.66
HCG18-241ENST00000602290 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.64□□□□□ -1.67
HCG18-241ENST00000602290 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP10-12P60413 245 aa4.58□□□□□ -1.68
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.57□□□□□ -1.68
HCG18-241ENST00000602290 MUC5ACP98088 5654 aa4.5□□□□□ -1.69
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.48□□□□□ -1.69
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.47□□□□□ -1.69
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.46□□□□□ -1.7
HCG18-241ENST00000602290 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.36□□□□□ -1.71
HCG18-241ENST00000602290 MT1EP04732 61 aa4.35□□□□□ -1.71
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.35□□□□□ -1.71
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.34□□□□□ -1.71
HCG18-241ENST00000602290 MT1GP13640 62 aa4.23□□□□□ -1.73
HCG18-241ENST00000602290 LCE3AQ5TA76 89 aa4.21□□□□□ -1.74
HCG18-241ENST00000602290 MT1MQ8N339 61 aa4.19□□□□□ -1.74
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-8O75690 187 aa4.13□□□□□ -1.75
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.12□□□□□ -1.75
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP12-3P60328 96 aa4.07□□□□□ -1.76
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
HCG18-241ENST00000602290 MT1LQ93083 61 aa4□□□□□ -1.77
HCG18-241ENST00000602290 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP12-4P60329 112 aa3.97□□□□□ -1.77
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.95□□□□□ -1.78
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.91□□□□□ -1.78
HCG18-241ENST00000602290 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.89□□□□□ -1.79
HCG18-241ENST00000602290 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.79□□□□□ -1.8
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.63□□□□□ -1.83
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.62□□□□□ -1.83
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.42□□□□□ -1.86
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.42□□□□□ -1.86
HCG18-241ENST00000602290 MT1AP04731 61 aa3.38□□□□□ -1.87
HCG18-241ENST00000602290 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.13□□□□□ -1.91
HCG18-241ENST00000602290 PRM1P04553 51 aa3.11□□□□□ -1.91
HCG18-241ENST00000602290 LCE1EQ5T753 118 aa3.09□□□□□ -1.91
HCG18-241ENST00000602290 MT3P25713 68 aa3.08□□□□□ -1.92
HCG18-241ENST00000602290 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.07□□□□□ -1.92
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
HCG18-241ENST00000602290 PHGR1C9JFL3 82 aa2.99□□□□□ -1.93
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.98□□□□□ -1.93
HCG18-241ENST00000602290 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.91□□□□□ -1.94
HCG18-241ENST00000602290 LCE1CQ5T751 118 aa2.88□□□□□ -1.95
HCG18-241ENST00000602290 LCE1FQ5T754 118 aa2.81□□□□□ -1.96
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.51□□□□□ -2.01
HCG18-241ENST00000602290 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.39□□□□□ -2.03
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.29□□□□□ -2.04
HCG18-241ENST00000602290 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.29□□□□□ -2.04
HCG18-241ENST00000602290 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.69□□□□□ -2.14
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