RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PMAIP1Q13794 54 aa6.99□□□□□ -1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPRR2DP22532 72 aa6.99□□□□□ -1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.99□□□□□ -1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MT1LQ93083 61 aa6.99□□□□□ -1.29
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PP632Q6XCG6 107 aa6.96□□□□□ -1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRO0628Q9UI54 55 aa6.93□□□□□ -1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MT1GP13640 62 aa6.92□□□□□ -1.3
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.87□□□□□ -1.31
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MT1MQ8N339 61 aa6.83□□□□□ -1.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.83□□□□□ -1.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.83□□□□□ -1.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.79□□□□□ -1.32
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE3BQ5TA77 95 aa6.76□□□□□ -1.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.74□□□□□ -1.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 H3BS24 57 aa6.72□□□□□ -1.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.71□□□□□ -1.33
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRAC1Q96KF2 57 aa6.66□□□□□ -1.34
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.64□□□□□ -1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.64□□□□□ -1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.61□□□□□ -1.35
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.57□□□□□ -1.36
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.5□□□□□ -1.37
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.35□□□□□ -1.39
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.23□□□□□ -1.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.19□□□□□ -1.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.18□□□□□ -1.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE4AQ5TA78 99 aa6.18□□□□□ -1.42
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MT4P47944 62 aa6.1□□□□□ -1.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 A0A0A0MQY5 61 aa6.09□□□□□ -1.43
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE1DQ5T752 114 aa6.09□□□□□ -1.44
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6□□□□□ -1.45
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.97□□□□□ -1.45
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.97□□□□□ -1.45
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MT1AP04731 61 aa5.93□□□□□ -1.46
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.91□□□□□ -1.46
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP12-4P60329 112 aa5.89□□□□□ -1.47
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.81□□□□□ -1.48
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.69□□□□□ -1.5
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.63□□□□□ -1.51
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.55□□□□□ -1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.53□□□□□ -1.52
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.51□□□□□ -1.53
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LUZP6Q538Z0 58 aa5.46□□□□□ -1.54
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.4□□□□□ -1.54
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MT3P25713 68 aa5.39□□□□□ -1.55
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.36□□□□□ -1.55
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.35□□□□□ -1.55
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.18□□□□□ -1.58
SMC5-AS1-201ENST00000594708 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.16□□□□□ -1.58
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.05□□□□□ -1.6
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.02□□□□□ -1.61
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-8O75690 187 aa5□□□□□ -1.61
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NDUFAF8A1L188 74 aa4.96□□□□□ -1.62
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.87□□□□□ -1.63
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.84□□□□□ -1.63
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE1EQ5T753 118 aa4.81□□□□□ -1.64
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MUC5ACP98088 5654 aa4.7□□□□□ -1.66
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.64□□□□□ -1.67
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.54□□□□□ -1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.53□□□□□ -1.68
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE1CQ5T751 118 aa4.48□□□□□ -1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
SMC5-AS1-201ENST00000594708 INE1O15225 51 aa4.01□□□□□ -1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4□□□□□ -1.77
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.88□□□□□ -1.79
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRM1P04553 51 aa3.81□□□□□ -1.8
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LCE1FQ5T754 118 aa3.74□□□□□ -1.81
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.51□□□□□ -1.85
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PHGR1C9JFL3 82 aa3.45□□□□□ -1.86
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.11□□□□□ -1.91
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.31□□□□□ -2.04
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.18□□□□□ -2.06
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