RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556778.5

PRKCH-222, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-222	ENST00000556778	KMT2D	O14686	5537 aa		3.64	□□□□□ -1.83
PRKCH-222	ENST00000556778	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.63	□□□□□ -1.83
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PRKCH-222	ENST00000556778	NEB	P20929	6669 aa		3.62	□□□□□ -1.83
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A0D9SG42	100 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A1B0GU33	70 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PRKCH-222	ENST00000556778	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRKCH-222	ENST00000556778		A0A1B0GU69	56 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRKCH-222	ENST00000556778	UQCR11	O14957	56 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.57	□□□□□ -1.84
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.55	□□□□□ -1.84
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PRKCH-222	ENST00000556778	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PRKCH-222	ENST00000556778	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.51	□□□□□ -1.85
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.48	□□□□□ -1.85
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.46	□□□□□ -1.86
PRKCH-222	ENST00000556778	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.44	□□□□□ -1.86
PRKCH-222	ENST00000556778	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PRKCH-222	ENST00000556778	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.38	□□□□□ -1.87
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRR2E	P22531	72 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRR2B	P35325	72 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRR2A	P35326	72 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.31	□□□□□ -1.88
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.28	□□□□□ -1.88
PRKCH-222	ENST00000556778	MT1E	P04732	61 aa		3.27	□□□□□ -1.89
PRKCH-222	ENST00000556778	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.26	□□□□□ -1.89
PRKCH-222	ENST00000556778	TNP1	P09430	55 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRR2D	P22532	72 aa		3.25	□□□□□ -1.89
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.24	□□□□□ -1.89
PRKCH-222	ENST00000556778	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.19	□□□□□ -1.9
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	MT1L	Q93083	61 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.13	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	MT1G	P13640	62 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.11	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	MT1M	Q8N339	61 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PRKCH-222	ENST00000556778	INE1	O15225	51 aa		3.07	□□□□□ -1.92
PRKCH-222	ENST00000556778	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PRKCH-222	ENST00000556778	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.92	□□□□□ -1.94
PRKCH-222	ENST00000556778	MT4	P47944	62 aa		2.88	□□□□□ -1.95
PRKCH-222	ENST00000556778	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.85	□□□□□ -1.95
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
PRKCH-222	ENST00000556778	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
PRKCH-222	ENST00000556778	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.81	□□□□□ -1.96
PRKCH-222	ENST00000556778	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.7	□□□□□ -1.98
PRKCH-222	ENST00000556778	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP12-4	P60329	112 aa		2.67	□□□□□ -1.98
PRKCH-222	ENST00000556778	MT1A	P04731	61 aa		2.65	□□□□□ -1.99
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.59	□□□□□ -1.99
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.58	□□□□□ -2
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.53	□□□□□ -2
PRKCH-222	ENST00000556778	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.53	□□□□□ -2
PRKCH-222	ENST00000556778	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.51	□□□□□ -2.01
PRKCH-222	ENST00000556778	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.51	□□□□□ -2.01
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.43	□□□□□ -2.02
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.36	□□□□□ -2.03
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.26	□□□□□ -2.05
PRKCH-222	ENST00000556778	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.04	□□□□□ -2.08
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.81	□□□□□ -2.12
PRKCH-222	ENST00000556778	PRM1	P04553	51 aa		1.63	□□□□□ -2.15
PRKCH-222	ENST00000556778	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.58	□□□□□ -2.16
PRKCH-222	ENST00000556778	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.21	□□□□□ -2.22
PRKCH-222	ENST00000556778	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.04	□□□□□ -2.24

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