RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545588.5

ZBED6-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 7,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-201ENST00000545588 LOC100996750A0A140TA64 210 aa1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 LCE1AQ5T7P2 110 aa1.5□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 MT1AP04731 61 aa1.49□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.48□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.48□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.48□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 HYDINQ4G0P3 5121 aa1.47□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.47□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.47□□□□□ -2.17
ZBED6-201ENST00000545588 LCE5AQ5TCM9 118 aa1.46□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa1.45□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 LCE4AQ5TA78 99 aa1.45□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 BIRC6Q9NR09 4857 aa1.44□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.44□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 HERC2O95714 4834 aa1.42□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 ABCA13Q86UQ4 5058 aa1.42□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa1.4□□□□□ -2.18
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.39□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa1.39□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 HMCN2Q8NDA2 5059 aa1.38□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa1.38□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 KIAA1109Q2LD37 5005 aa1.38□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 MUC2Q02817 5179 aa1.38□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 HERC1Q15751 4861 aa1.36□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.36□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 LCE1CQ5T751 118 aa1.35□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 LCE1EQ5T753 118 aa1.35□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 LCE1FQ5T754 118 aa1.35□□□□□ -2.19
ZBED6-201ENST00000545588 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.33□□□□□ -2.2
ZBED6-201ENST00000545588 FSIP2Q5CZC0 6907 aa1.31□□□□□ -2.2
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa1.31□□□□□ -2.2
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.29□□□□□ -2.2
ZBED6-201ENST00000545588 USH2AO75445 5202 aa1.29□□□□□ -2.2
ZBED6-201ENST00000545588 UBR4Q5T4S7 5183 aa1.28□□□□□ -2.21
ZBED6-201ENST00000545588 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
ZBED6-201ENST00000545588 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.26□□□□□ -2.21
ZBED6-201ENST00000545588 KMT2DO14686 5537 aa1.25□□□□□ -2.21
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-9P26371 169 aa1.21□□□□□ -2.22
ZBED6-201ENST00000545588 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.18□□□□□ -2.22
ZBED6-201ENST00000545588 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.17□□□□□ -2.22
ZBED6-201ENST00000545588 RNF213Q63HN8 5207 aa1.17□□□□□ -2.22
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa1.16□□□□□ -2.22
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa1.16□□□□□ -2.22
ZBED6-201ENST00000545588 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.16□□□□□ -2.22
ZBED6-201ENST00000545588 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.13□□□□□ -2.23
ZBED6-201ENST00000545588 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
ZBED6-201ENST00000545588 SSPOA2VEC9 5147 aa1.12□□□□□ -2.23
ZBED6-201ENST00000545588 MDN1Q9NU22 5596 aa1.09□□□□□ -2.23
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.09□□□□□ -2.23
ZBED6-201ENST00000545588 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
ZBED6-201ENST00000545588 NEBP20929 6669 aa1.07□□□□□ -2.24
ZBED6-201ENST00000545588 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.06□□□□□ -2.24
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.02□□□□□ -2.25
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.01□□□□□ -2.25
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.01□□□□□ -2.25
ZBED6-201ENST00000545588 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1□□□□□ -2.25
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa0.99□□□□□ -2.25
ZBED6-201ENST00000545588 MUC5ACP98088 5654 aa0.98□□□□□ -2.25
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
ZBED6-201ENST00000545588 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.95□□□□□ -2.26
ZBED6-201ENST00000545588 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa0.94□□□□□ -2.26
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-8O75690 187 aa0.83□□□□□ -2.28
ZBED6-201ENST00000545588 PHGR1C9JFL3 82 aa0.82□□□□□ -2.28
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.81□□□□□ -2.28
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa0.77□□□□□ -2.29
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa0.7□□□□□ -2.3
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa0.68□□□□□ -2.3
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.68□□□□□ -2.3
ZBED6-201ENST00000545588 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.61□□□□□ -2.31
ZBED6-201ENST00000545588 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms