RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 SPRR2AP35326 72 aa2.39□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 R4GN34 69 aa2.39□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 PLAC4Q8WY50 150 aa2.38□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP10-12P60413 245 aa2.38□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.37□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.36□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 MDN1Q9NU22 5596 aa2.35□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 KMT2DO14686 5537 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 LINC00208Q96KT6 92 aa2.34□□□□□ -2.03
ANKRD49-208ENST00000544253 M0QZ58 72 aa2.32□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 SPRR2DP22532 72 aa2.32□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 A0A1B0GU33 70 aa2.31□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.31□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.31□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.3□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.3□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 ACYP2P14621 99 aa2.29□□□□□ -2.04
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE4AQ5TA78 99 aa2.27□□□□□ -2.05
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.27□□□□□ -2.05
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP5-8O75690 187 aa2.26□□□□□ -2.05
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.21□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.21□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 COA5Q86WW8 74 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 A0A1B0GU69 56 aa2.19□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 UQCR11O14957 56 aa2.17□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.17□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 MT1EP04732 61 aa2.17□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.17□□□□□ -2.06
ANKRD49-208ENST00000544253 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.15□□□□□ -2.07
ANKRD49-208ENST00000544253 MT1GP13640 62 aa2.14□□□□□ -2.07
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.13□□□□□ -2.07
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.12□□□□□ -2.07
ANKRD49-208ENST00000544253 PP632Q6XCG6 107 aa2.11□□□□□ -2.07
ANKRD49-208ENST00000544253 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.1□□□□□ -2.07
ANKRD49-208ENST00000544253 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.09□□□□□ -2.07
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP12-1P59990 96 aa2.07□□□□□ -2.08
ANKRD49-208ENST00000544253 MT1MQ8N339 61 aa2.06□□□□□ -2.08
ANKRD49-208ENST00000544253 MT1LQ93083 61 aa2.06□□□□□ -2.08
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.04□□□□□ -2.08
ANKRD49-208ENST00000544253 A0A0D9SG42 100 aa2.04□□□□□ -2.08
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.01□□□□□ -2.09
ANKRD49-208ENST00000544253 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2□□□□□ -2.09
ANKRD49-208ENST00000544253 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2□□□□□ -2.09
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2□□□□□ -2.09
ANKRD49-208ENST00000544253 TNP1P09430 55 aa1.99□□□□□ -2.09
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE1FQ5T754 118 aa1.98□□□□□ -2.09
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
ANKRD49-208ENST00000544253 MT4P47944 62 aa1.96□□□□□ -2.1
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE3AQ5TA76 89 aa1.96□□□□□ -2.1
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE3CQ5T5A8 94 aa1.93□□□□□ -2.1
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP12-3P60328 96 aa1.92□□□□□ -2.1
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.91□□□□□ -2.1
ANKRD49-208ENST00000544253 INE1O15225 51 aa1.9□□□□□ -2.11
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.88□□□□□ -2.11
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP12-4P60329 112 aa1.88□□□□□ -2.11
ANKRD49-208ENST00000544253 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.87□□□□□ -2.11
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE1EQ5T753 118 aa1.87□□□□□ -2.11
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.82□□□□□ -2.12
ANKRD49-208ENST00000544253 MT1AP04731 61 aa1.79□□□□□ -2.12
ANKRD49-208ENST00000544253 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.78□□□□□ -2.12
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.69□□□□□ -2.14
ANKRD49-208ENST00000544253 MUC5ACP98088 5654 aa1.68□□□□□ -2.14
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.68□□□□□ -2.14
ANKRD49-208ENST00000544253 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.62□□□□□ -2.15
ANKRD49-208ENST00000544253 MT3P25713 68 aa1.62□□□□□ -2.15
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.62□□□□□ -2.15
ANKRD49-208ENST00000544253 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.57□□□□□ -2.16
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE1CQ5T751 118 aa1.46□□□□□ -2.18
ANKRD49-208ENST00000544253 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.46□□□□□ -2.18
ANKRD49-208ENST00000544253 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.39□□□□□ -2.19
ANKRD49-208ENST00000544253 PRM1P04553 51 aa1.18□□□□□ -2.22
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.17□□□□□ -2.22
ANKRD49-208ENST00000544253 PHGR1C9JFL3 82 aa1.14□□□□□ -2.23
ANKRD49-208ENST00000544253 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.94□□□□□ -2.26
ANKRD49-208ENST00000544253 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms