RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 SPRR2BP35325 72 aa7.43□□□□□ -1.22
TSTA3-215ENST00000532308 SPRR2AP35326 72 aa7.43□□□□□ -1.22
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.41□□□□□ -1.22
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.41□□□□□ -1.22
TSTA3-215ENST00000532308 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.39□□□□□ -1.23
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.33□□□□□ -1.24
TSTA3-215ENST00000532308 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.33□□□□□ -1.24
TSTA3-215ENST00000532308 PRAC1Q96KF2 57 aa7.31□□□□□ -1.24
TSTA3-215ENST00000532308 MT1LQ93083 61 aa7.3□□□□□ -1.24
TSTA3-215ENST00000532308 MT1GP13640 62 aa7.25□□□□□ -1.25
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.25□□□□□ -1.25
TSTA3-215ENST00000532308 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.23□□□□□ -1.25
TSTA3-215ENST00000532308 SPRR2DP22532 72 aa7.17□□□□□ -1.26
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.16□□□□□ -1.26
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.13□□□□□ -1.27
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.13□□□□□ -1.27
TSTA3-215ENST00000532308 MT1MQ8N339 61 aa7.11□□□□□ -1.27
TSTA3-215ENST00000532308 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.1□□□□□ -1.27
TSTA3-215ENST00000532308 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.98□□□□□ -1.29
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.96□□□□□ -1.3
TSTA3-215ENST00000532308 SVIPQ8NHG7 77 aa6.94□□□□□ -1.3
TSTA3-215ENST00000532308 LCE3BQ5TA77 95 aa6.92□□□□□ -1.3
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.9□□□□□ -1.3
TSTA3-215ENST00000532308 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
TSTA3-215ENST00000532308 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.56□□□□□ -1.36
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.51□□□□□ -1.37
TSTA3-215ENST00000532308 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.49□□□□□ -1.37
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TSTA3-215ENST00000532308 LCE4AQ5TA78 99 aa6.4□□□□□ -1.38
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.38□□□□□ -1.39
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.37□□□□□ -1.39
TSTA3-215ENST00000532308 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.29□□□□□ -1.4
TSTA3-215ENST00000532308 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.26□□□□□ -1.41
TSTA3-215ENST00000532308 MT1AP04731 61 aa6.23□□□□□ -1.41
TSTA3-215ENST00000532308 MT4P47944 62 aa6.2□□□□□ -1.42
TSTA3-215ENST00000532308 LCE1DQ5T752 114 aa6.19□□□□□ -1.42
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.19□□□□□ -1.42
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP12-4P60329 112 aa6.15□□□□□ -1.42
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.14□□□□□ -1.43
TSTA3-215ENST00000532308 LUZP6Q538Z0 58 aa6.12□□□□□ -1.43
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.09□□□□□ -1.43
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.06□□□□□ -1.44
TSTA3-215ENST00000532308 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.97□□□□□ -1.45
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.96□□□□□ -1.46
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.84□□□□□ -1.47
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.73□□□□□ -1.49
TSTA3-215ENST00000532308 MT3P25713 68 aa5.69□□□□□ -1.5
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.69□□□□□ -1.5
TSTA3-215ENST00000532308 NDUFAF8A1L188 74 aa5.58□□□□□ -1.52
TSTA3-215ENST00000532308 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
TSTA3-215ENST00000532308 MUC5ACP98088 5654 aa5.35□□□□□ -1.55
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.28□□□□□ -1.56
TSTA3-215ENST00000532308 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
TSTA3-215ENST00000532308 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.18□□□□□ -1.58
TSTA3-215ENST00000532308 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.11□□□□□ -1.59
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-8O75690 187 aa5.08□□□□□ -1.6
TSTA3-215ENST00000532308 LCE1EQ5T753 118 aa5.05□□□□□ -1.6
TSTA3-215ENST00000532308 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.99□□□□□ -1.61
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.98□□□□□ -1.61
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.87□□□□□ -1.63
TSTA3-215ENST00000532308 A0A0A0MQY5 61 aa4.85□□□□□ -1.63
TSTA3-215ENST00000532308 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.7□□□□□ -1.66
TSTA3-215ENST00000532308 LCE1CQ5T751 118 aa4.68□□□□□ -1.66
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.67□□□□□ -1.66
TSTA3-215ENST00000532308 INE1O15225 51 aa4.65□□□□□ -1.67
TSTA3-215ENST00000532308 H3BS24 57 aa4.34□□□□□ -1.71
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.16□□□□□ -1.74
TSTA3-215ENST00000532308 PRM1P04553 51 aa4.12□□□□□ -1.75
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.02□□□□□ -1.77
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.99□□□□□ -1.77
TSTA3-215ENST00000532308 LCE1FQ5T754 118 aa3.91□□□□□ -1.78
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.59□□□□□ -1.83
TSTA3-215ENST00000532308 PHGR1C9JFL3 82 aa3.57□□□□□ -1.84
TSTA3-215ENST00000532308 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.07□□□□□ -1.92
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.76□□□□□ -1.97
TSTA3-215ENST00000532308 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.31□□□□□ -2.04
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