RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRR2EP22531 72 aa3.06□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRR2BP35325 72 aa3.06□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRR2AP35326 72 aa3.06□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.05□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.03□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1LQ93083 61 aa3.03□□□□□ -1.92
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.02□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.02□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1GP13640 62 aa2.99□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.97□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.96□□□□□ -1.93
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE3BQ5TA77 95 aa2.96□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRR2DP22532 72 aa2.95□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.95□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1MQ8N339 61 aa2.94□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.93□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.93□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MDN1Q9NU22 5596 aa2.92□□□□□ -1.94
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.9□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.9□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NEBP20929 6669 aa2.89□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.89□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE4AQ5TA78 99 aa2.84□□□□□ -1.95
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.83□□□□□ -1.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.83□□□□□ -1.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.82□□□□□ -1.96
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE1DQ5T752 114 aa2.76□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.76□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.76□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.75□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.74□□□□□ -1.97
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.67□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LUZP6Q538Z0 58 aa2.66□□□□□ -1.98
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.6□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFAF8A1L188 74 aa2.59□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.59□□□□□ -1.99
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT1AP04731 61 aa2.58□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.58□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT4P47944 62 aa2.57□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.55□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP12-4P60329 112 aa2.54□□□□□ -2
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.44□□□□□ -2.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.4□□□□□ -2.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.39□□□□□ -2.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MT3P25713 68 aa2.37□□□□□ -2.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.35□□□□□ -2.03
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.32□□□□□ -2.04
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0A0MQY5 61 aa2.21□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.19□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.19□□□□□ -2.06
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.15□□□□□ -2.07
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.12□□□□□ -2.07
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.11□□□□□ -2.07
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INE1O15225 51 aa2.07□□□□□ -2.08
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-8O75690 187 aa2.06□□□□□ -2.08
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE1EQ5T753 118 aa2.06□□□□□ -2.08
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.03□□□□□ -2.08
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.03□□□□□ -2.08
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.02□□□□□ -2.09
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.98□□□□□ -2.09
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUC5ACP98088 5654 aa1.92□□□□□ -2.1
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE1CQ5T751 118 aa1.91□□□□□ -2.1
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRM1P04553 51 aa1.77□□□□□ -2.13
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.77□□□□□ -2.13
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCE1FQ5T754 118 aa1.72□□□□□ -2.13
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.67□□□□□ -2.14
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.52□□□□□ -2.17
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PHGR1C9JFL3 82 aa1.46□□□□□ -2.18
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.23□□□□□ -2.21
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.05□□□□□ -2.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.93□□□□□ -2.26
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