RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 XIRP2A4UGR9 3374 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 AKAP9Q99996 3911 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH7Q8WXX0 4024 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRIOO75962 3097 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 MGAQ8IWI9 3026 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 CDH23Q9H251 3354 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 LRP2P98164 4655 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB1P60022 68 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-347P-201ENST00000516658 ATMQ13315 3056 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRCDQ00LT1 54 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.32□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHD7Q9P2D1 2997 aa0.31□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 STARD9Q9P2P6 4700 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 DMDP11532 3685 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-347P-201ENST00000516658 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.26□□□□□ -2.37
RNU6-347P-201ENST00000516658 TTTY10Q9BZA0 68 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-347P-201ENST00000516658 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa0.25□□□□□ -2.37
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.24□□□□□ -2.37
RNU6-347P-201ENST00000516658 K7EIM0 57 aa0.23□□□□□ -2.37
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH5Q8TE73 4624 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB136Q30KP8 78 aa0.21□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH8Q96JB1 4490 aa0.2□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 MUC17Q685J3 4493 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAT1Q14517 4588 aa0.18□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa0.17□□□□□ -2.38
RNU6-347P-201ENST00000516658 H3BUX3 64 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1HP80294 61 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 H3BSH0 61 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH10Q8IVF4 4471 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT4P47944 62 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A096LNI7 61 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAH17Q9UFH2 4485 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-347P-201ENST00000516658 HTN1P15515 57 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1EP04732 61 aa0.05□□□□□ -2.4
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB133Q30KQ1 61 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB124Q8NES8 71 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1LQ93083 61 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB4AO15263 64 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1XP80297 61 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-347P-201ENST00000516658 RPL39P5Q59GN2 51 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-347P-201ENST00000516658 CD52P31358 61 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-347P-201ENST00000516658 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.12□□□□□ -2.43
RNU6-347P-201ENST00000516658 APELAP0DMC3 54 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1GP13640 62 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT2AP02795 61 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1MQ8N339 61 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1BP07438 61 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-347P-201ENST00000516658 Q9Y3F1 56 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A096LPF7 62 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-347P-201ENST00000516658 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-347P-201ENST00000516658 MT1FP04733 61 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-347P-201ENST00000516658 HTN3P15516 51 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-347P-201ENST00000516658 DEFB108BQ8NET1 73 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-347P-201ENST00000516658 COX14Q96I36 57 aa-0.72□□□□□ -2.52
RNU6-347P-201ENST00000516658 STATHP02808 62 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 206.1 ms