RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-208ENST00000502484 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-208ENST00000502484 LCE3AQ5TA76 89 aa3.27□□□□□ -1.89
PDE4D-208ENST00000502484 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-12P60413 245 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-208ENST00000502484 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.9
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP12-3P60328 96 aa3.13□□□□□ -1.91
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.12□□□□□ -1.91
PDE4D-208ENST00000502484 KMT2DO14686 5537 aa3.1□□□□□ -1.91
PDE4D-208ENST00000502484 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3□□□□□ -1.93
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-9P26371 169 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-208ENST00000502484 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-208ENST00000502484 MT1EP04732 61 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-208ENST00000502484 NEBP20929 6669 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-208ENST00000502484 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-208ENST00000502484 MT1LQ93083 61 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-208ENST00000502484 INE1O15225 51 aa2.87□□□□□ -1.95
PDE4D-208ENST00000502484 MDN1Q9NU22 5596 aa2.86□□□□□ -1.95
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR2EP22531 72 aa2.84□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR2BP35325 72 aa2.84□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR2AP35326 72 aa2.84□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.82□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.8□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.8□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.79□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.78□□□□□ -1.96
PDE4D-208ENST00000502484 MT1GP13640 62 aa2.77□□□□□ -1.97
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PDE4D-208ENST00000502484 MT1MQ8N339 61 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-208ENST00000502484 SPRR2DP22532 72 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.7□□□□□ -1.98
PDE4D-208ENST00000502484 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.65□□□□□ -1.98
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.65□□□□□ -1.99
PDE4D-208ENST00000502484 LCE1EQ5T753 118 aa2.61□□□□□ -1.99
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.59□□□□□ -2
PDE4D-208ENST00000502484 MT3P25713 68 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-208ENST00000502484 MT1AP04731 61 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.41□□□□□ -2.02
PDE4D-208ENST00000502484 MT4P47944 62 aa2.4□□□□□ -2.03
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.39□□□□□ -2.03
PDE4D-208ENST00000502484 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PDE4D-208ENST00000502484 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.35□□□□□ -2.03
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.33□□□□□ -2.04
PDE4D-208ENST00000502484 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP12-4P60329 112 aa2.32□□□□□ -2.04
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.28□□□□□ -2.04
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.27□□□□□ -2.05
PDE4D-208ENST00000502484 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
PDE4D-208ENST00000502484 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PDE4D-208ENST00000502484 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.22□□□□□ -2.05
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.2□□□□□ -2.06
PDE4D-208ENST00000502484 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.18□□□□□ -2.06
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.13□□□□□ -2.07
PDE4D-208ENST00000502484 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.12□□□□□ -2.07
PDE4D-208ENST00000502484 LCE1FQ5T754 118 aa2.03□□□□□ -2.08
PDE4D-208ENST00000502484 MUC5ACP98088 5654 aa2.01□□□□□ -2.09
PDE4D-208ENST00000502484 PRM1P04553 51 aa1.98□□□□□ -2.09
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP5-8O75690 187 aa1.94□□□□□ -2.1
PDE4D-208ENST00000502484 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.78□□□□□ -2.12
PDE4D-208ENST00000502484 LCE1CQ5T751 118 aa1.77□□□□□ -2.13
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.6□□□□□ -2.15
PDE4D-208ENST00000502484 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.44□□□□□ -2.18
PDE4D-208ENST00000502484 PHGR1C9JFL3 82 aa1.35□□□□□ -2.19
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.24□□□□□ -2.21
PDE4D-208ENST00000502484 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms