RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497700.1

ELL3-208, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, human

TSL 3

Gene ELL3, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
ELL3-208	ENST00000497700	LCE3B	Q5TA77	95 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ELL3-208	ENST00000497700	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		7.17	□□□□□ -1.26
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP10-12	P60413	245 aa		7.1	□□□□□ -1.27
ELL3-208	ENST00000497700	TNP1	P09430	55 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ELL3-208	ENST00000497700	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ELL3-208	ENST00000497700	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.89	□□□□□ -1.31
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.85	□□□□□ -1.31
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.84	□□□□□ -1.31
ELL3-208	ENST00000497700	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.83	□□□□□ -1.32
ELL3-208	ENST00000497700	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.74	□□□□□ -1.33
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.73	□□□□□ -1.33
ELL3-208	ENST00000497700	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.69	□□□□□ -1.34
ELL3-208	ENST00000497700	MT1E	P04732	61 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ELL3-208	ENST00000497700	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ELL3-208	ENST00000497700	MT4	P47944	62 aa		6.51	□□□□□ -1.37
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.5	□□□□□ -1.37
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.47	□□□□□ -1.37
ELL3-208	ENST00000497700	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.46	□□□□□ -1.37
ELL3-208	ENST00000497700	MT1G	P13640	62 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.44	□□□□□ -1.38
ELL3-208	ENST00000497700	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.43	□□□□□ -1.38
ELL3-208	ENST00000497700	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.4	□□□□□ -1.39
ELL3-208	ENST00000497700	MT1M	Q8N339	61 aa		6.39	□□□□□ -1.39
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ELL3-208	ENST00000497700	MT1L	Q93083	61 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.29	□□□□□ -1.4
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ELL3-208	ENST00000497700	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.15	□□□□□ -1.42
ELL3-208	ENST00000497700	LUZP6	Q538Z0	58 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ELL3-208	ENST00000497700	NDUFAF8	A1L188	74 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ELL3-208	ENST00000497700	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
ELL3-208	ENST00000497700		H3BS24	57 aa		5.79	□□□□□ -1.48
ELL3-208	ENST00000497700	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.78	□□□□□ -1.48
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.76	□□□□□ -1.49
ELL3-208	ENST00000497700	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ELL3-208	ENST00000497700		A0A0A0MQY5	61 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.52	□□□□□ -1.53
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.37	□□□□□ -1.55
ELL3-208	ENST00000497700	MT1A	P04731	61 aa		5.35	□□□□□ -1.55
ELL3-208	ENST00000497700	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
ELL3-208	ENST00000497700	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.29	□□□□□ -1.56
ELL3-208	ENST00000497700	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.26	□□□□□ -1.57
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ELL3-208	ENST00000497700	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.17	□□□□□ -1.58
ELL3-208	ENST00000497700	INE1	O15225	51 aa		5.16	□□□□□ -1.58
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ELL3-208	ENST00000497700	MT3	P25713	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ELL3-208	ENST00000497700	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ELL3-208	ENST00000497700	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ELL3-208	ENST00000497700	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ELL3-208	ENST00000497700	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ELL3-208	ENST00000497700	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.19	□□□□□ -1.74
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ELL3-208	ENST00000497700	PRM1	P04553	51 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ELL3-208	ENST00000497700	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
ELL3-208	ENST00000497700	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.7	□□□□□ -1.82
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.38	□□□□□ -1.87
ELL3-208	ENST00000497700	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ELL3-208	ENST00000497700	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ELL3-208	ENST00000497700	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.26	□□□□□ -2.05

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