RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494664.5

TIMMDC1-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMMDC1, Length 2,394 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE1DQ5T752 114 aa4.67□□□□□ -1.66
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.67□□□□□ -1.66
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE3AQ5TA76 89 aa4.67□□□□□ -1.66
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.67□□□□□ -1.66
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP10-12P60413 245 aa4.62□□□□□ -1.67
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.58□□□□□ -1.68
TIMMDC1-208ENST00000494664 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.54□□□□□ -1.68
TIMMDC1-208ENST00000494664 MDN1Q9NU22 5596 aa4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP12-3P60328 96 aa4.46□□□□□ -1.7
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-9P26371 169 aa4.45□□□□□ -1.7
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.42□□□□□ -1.7
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.37□□□□□ -1.71
TIMMDC1-208ENST00000494664 NEBP20929 6669 aa4.36□□□□□ -1.71
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.34□□□□□ -1.71
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1EP04732 61 aa4.3□□□□□ -1.72
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.27□□□□□ -1.73
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRR2EP22531 72 aa4.25□□□□□ -1.73
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRR2BP35325 72 aa4.25□□□□□ -1.73
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRR2AP35326 72 aa4.25□□□□□ -1.73
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.22□□□□□ -1.73
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.17□□□□□ -1.74
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1LQ93083 61 aa4.17□□□□□ -1.74
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.15□□□□□ -1.75
TIMMDC1-208ENST00000494664 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TIMMDC1-208ENST00000494664 SPRR2DP22532 72 aa4.1□□□□□ -1.75
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1GP13640 62 aa4.09□□□□□ -1.76
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.07□□□□□ -1.76
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.07□□□□□ -1.76
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.07□□□□□ -1.76
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1MQ8N339 61 aa4.06□□□□□ -1.76
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.03□□□□□ -1.76
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.99□□□□□ -1.77
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.98□□□□□ -1.77
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.86□□□□□ -1.79
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP12-4P60329 112 aa3.68□□□□□ -1.82
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.66□□□□□ -1.82
TIMMDC1-208ENST00000494664 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.65□□□□□ -1.82
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE4AQ5TA78 99 aa3.6□□□□□ -1.83
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT4P47944 62 aa3.59□□□□□ -1.83
TIMMDC1-208ENST00000494664 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.53□□□□□ -1.84
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT1AP04731 61 aa3.52□□□□□ -1.85
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.44□□□□□ -1.86
TIMMDC1-208ENST00000494664 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.32□□□□□ -1.88
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.31□□□□□ -1.88
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMMDC1-208ENST00000494664 PRM1P04553 51 aa3.29□□□□□ -1.88
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.27□□□□□ -1.89
TIMMDC1-208ENST00000494664 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.26□□□□□ -1.89
TIMMDC1-208ENST00000494664 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.21□□□□□ -1.9
TIMMDC1-208ENST00000494664 MT3P25713 68 aa3.18□□□□□ -1.9
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.14□□□□□ -1.91
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE1EQ5T753 118 aa3.08□□□□□ -1.92
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE1FQ5T754 118 aa3.01□□□□□ -1.93
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-8O75690 187 aa2.95□□□□□ -1.94
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.93□□□□□ -1.94
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1-208ENST00000494664 MUC5ACP98088 5654 aa2.88□□□□□ -1.95
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.83□□□□□ -1.96
TIMMDC1-208ENST00000494664 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.69□□□□□ -1.98
TIMMDC1-208ENST00000494664 LCE1CQ5T751 118 aa2.65□□□□□ -1.98
TIMMDC1-208ENST00000494664 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.32□□□□□ -2.04
TIMMDC1-208ENST00000494664 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.12□□□□□ -2.07
TIMMDC1-208ENST00000494664 PHGR1C9JFL3 82 aa2.05□□□□□ -2.08
TIMMDC1-208ENST00000494664 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.94□□□□□ -2.1
TIMMDC1-208ENST00000494664 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.27□□□□□ -2.21
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