RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.34□□□□□ -1.72
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.3□□□□□ -1.72
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.28□□□□□ -1.72
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.28□□□□□ -1.72
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.28□□□□□ -1.72
PRAME-213ENST00000492657 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.27□□□□□ -1.73
PRAME-213ENST00000492657 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PRAME-213ENST00000492657 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.23□□□□□ -1.73
PRAME-213ENST00000492657 MT1MQ8N339 61 aa4.22□□□□□ -1.73
PRAME-213ENST00000492657 MT1GP13640 62 aa4.22□□□□□ -1.73
PRAME-213ENST00000492657 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
PRAME-213ENST00000492657 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.18□□□□□ -1.74
PRAME-213ENST00000492657 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.16□□□□□ -1.74
PRAME-213ENST00000492657 MDN1Q9NU22 5596 aa4.13□□□□□ -1.75
PRAME-213ENST00000492657 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.11□□□□□ -1.75
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.06□□□□□ -1.76
PRAME-213ENST00000492657 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP12-4P60329 112 aa3.99□□□□□ -1.77
PRAME-213ENST00000492657 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.97□□□□□ -1.77
PRAME-213ENST00000492657 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.91□□□□□ -1.78
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.91□□□□□ -1.78
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-9P26371 169 aa3.88□□□□□ -1.79
PRAME-213ENST00000492657 LCE3BQ5TA77 95 aa3.86□□□□□ -1.79
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.84□□□□□ -1.79
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.84□□□□□ -1.8
PRAME-213ENST00000492657 SPRR2EP22531 72 aa3.83□□□□□ -1.8
PRAME-213ENST00000492657 SPRR2BP35325 72 aa3.83□□□□□ -1.8
PRAME-213ENST00000492657 SPRR2AP35326 72 aa3.83□□□□□ -1.8
PRAME-213ENST00000492657 MT1AP04731 61 aa3.75□□□□□ -1.81
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.68□□□□□ -1.82
PRAME-213ENST00000492657 LCE1EQ5T753 118 aa3.67□□□□□ -1.82
PRAME-213ENST00000492657 SPRR2DP22532 72 aa3.66□□□□□ -1.82
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.62□□□□□ -1.83
PRAME-213ENST00000492657 PRM1P04553 51 aa3.59□□□□□ -1.83
PRAME-213ENST00000492657 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.59□□□□□ -1.84
PRAME-213ENST00000492657 LCE1FQ5T754 118 aa3.58□□□□□ -1.84
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.55□□□□□ -1.84
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.55□□□□□ -1.84
PRAME-213ENST00000492657 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.53□□□□□ -1.84
PRAME-213ENST00000492657 NEBP20929 6669 aa3.51□□□□□ -1.85
PRAME-213ENST00000492657 LCE1DQ5T752 114 aa3.48□□□□□ -1.85
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.46□□□□□ -1.86
PRAME-213ENST00000492657 MT3P25713 68 aa3.37□□□□□ -1.87
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.34□□□□□ -1.88
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.29□□□□□ -1.88
PRAME-213ENST00000492657 MT4P47944 62 aa3.27□□□□□ -1.89
PRAME-213ENST00000492657 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.22□□□□□ -1.89
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.16□□□□□ -1.9
PRAME-213ENST00000492657 LCE4AQ5TA78 99 aa3.13□□□□□ -1.91
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.11□□□□□ -1.91
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.1□□□□□ -1.91
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.01□□□□□ -1.93
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.98□□□□□ -1.93
PRAME-213ENST00000492657 MUC5ACP98088 5654 aa2.95□□□□□ -1.94
PRAME-213ENST00000492657 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.86□□□□□ -1.95
PRAME-213ENST00000492657 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.8□□□□□ -1.96
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.77□□□□□ -1.97
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.67□□□□□ -1.98
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.67□□□□□ -1.98
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.64□□□□□ -1.99
PRAME-213ENST00000492657 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.63□□□□□ -1.99
PRAME-213ENST00000492657 LCE1CQ5T751 118 aa2.62□□□□□ -1.99
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-8O75690 187 aa2.53□□□□□ -2
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.46□□□□□ -2.01
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.43□□□□□ -2.02
PRAME-213ENST00000492657 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
PRAME-213ENST00000492657 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.33□□□□□ -2.04
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.32□□□□□ -2.04
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.25□□□□□ -2.05
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.25□□□□□ -2.05
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.13□□□□□ -2.07
PRAME-213ENST00000492657 PHGR1C9JFL3 82 aa1.96□□□□□ -2.1
PRAME-213ENST00000492657 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.91□□□□□ -2.1
PRAME-213ENST00000492657 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.31□□□□□ -2.2
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