RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 MT1LQ93083 61 aa7.08□□□□□ -1.28
NELFE-211ENST00000492185 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
NELFE-211ENST00000492185 H3BS24 57 aa6.97□□□□□ -1.29
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-211ENST00000492185 MT1GP13640 62 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-211ENST00000492185 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-211ENST00000492185 MT1MQ8N339 61 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-211ENST00000492185 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-211ENST00000492185 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-9P26371 169 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.61□□□□□ -1.35
NELFE-211ENST00000492185 NEBP20929 6669 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-211ENST00000492185 A0A0A0MQY5 61 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-211ENST00000492185 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.45□□□□□ -1.38
NELFE-211ENST00000492185 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.44□□□□□ -1.38
NELFE-211ENST00000492185 MDN1Q9NU22 5596 aa6.38□□□□□ -1.39
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-211ENST00000492185 SPRR2EP22531 72 aa6.33□□□□□ -1.4
NELFE-211ENST00000492185 SPRR2BP35325 72 aa6.33□□□□□ -1.4
NELFE-211ENST00000492185 SPRR2AP35326 72 aa6.33□□□□□ -1.4
NELFE-211ENST00000492185 INE1O15225 51 aa6.11□□□□□ -1.43
NELFE-211ENST00000492185 SPRR2DP22532 72 aa6.08□□□□□ -1.44
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
NELFE-211ENST00000492185 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
NELFE-211ENST00000492185 MT1AP04731 61 aa6.01□□□□□ -1.45
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.95□□□□□ -1.46
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.93□□□□□ -1.46
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.85□□□□□ -1.47
NELFE-211ENST00000492185 LCE3BQ5TA77 95 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-211ENST00000492185 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.66□□□□□ -1.5
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP12-4P60329 112 aa5.48□□□□□ -1.53
NELFE-211ENST00000492185 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.44□□□□□ -1.54
NELFE-211ENST00000492185 LCE4AQ5TA78 99 aa5.44□□□□□ -1.54
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.42□□□□□ -1.54
NELFE-211ENST00000492185 MT3P25713 68 aa5.39□□□□□ -1.55
NELFE-211ENST00000492185 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.39□□□□□ -1.55
NELFE-211ENST00000492185 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.28□□□□□ -1.56
NELFE-211ENST00000492185 LCE1DQ5T752 114 aa5.27□□□□□ -1.57
NELFE-211ENST00000492185 MT4P47944 62 aa5.26□□□□□ -1.57
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-211ENST00000492185 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.23□□□□□ -1.57
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.2□□□□□ -1.58
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.08□□□□□ -1.6
NELFE-211ENST00000492185 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.06□□□□□ -1.6
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5□□□□□ -1.61
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.97□□□□□ -1.61
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.94□□□□□ -1.62
NELFE-211ENST00000492185 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.85□□□□□ -1.63
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.8□□□□□ -1.64
NELFE-211ENST00000492185 PRM1P04553 51 aa4.74□□□□□ -1.65
NELFE-211ENST00000492185 LCE1EQ5T753 118 aa4.65□□□□□ -1.67
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.55□□□□□ -1.68
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.46□□□□□ -1.7
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.44□□□□□ -1.7
NELFE-211ENST00000492185 MUC5ACP98088 5654 aa4.4□□□□□ -1.71
NELFE-211ENST00000492185 LCE1CQ5T751 118 aa4.34□□□□□ -1.71
NELFE-211ENST00000492185 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.34□□□□□ -1.71
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-8O75690 187 aa4.31□□□□□ -1.72
NELFE-211ENST00000492185 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
NELFE-211ENST00000492185 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.92□□□□□ -1.78
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.81□□□□□ -1.8
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.41□□□□□ -1.86
NELFE-211ENST00000492185 LCE1FQ5T754 118 aa3.34□□□□□ -1.87
NELFE-211ENST00000492185 PHGR1C9JFL3 82 aa3.26□□□□□ -1.89
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3□□□□□ -1.93
NELFE-211ENST00000492185 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.83□□□□□ -1.96
NELFE-211ENST00000492185 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.16□□□□□ -2.06
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