RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.28	□□□□□ -1.89
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.28	□□□□□ -1.89
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1L	Q93083	61 aa		3.26	□□□□□ -1.89
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.25	□□□□□ -1.89
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.25	□□□□□ -1.89
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.25	□□□□□ -1.89
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1E	P04732	61 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.2	□□□□□ -1.9
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.16	□□□□□ -1.9
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.12	□□□□□ -1.91
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ERCC3-208	ENST00000491292	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.1	□□□□□ -1.91
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.03	□□□□□ -1.93
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1M	Q8N339	61 aa		3.03	□□□□□ -1.93
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.96	□□□□□ -1.94
ERCC3-208	ENST00000491292	PRM1	P04553	51 aa		2.94	□□□□□ -1.94
ERCC3-208	ENST00000491292	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.92	□□□□□ -1.94
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR2E	P22531	72 aa		2.9	□□□□□ -1.94
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR2B	P35325	72 aa		2.9	□□□□□ -1.94
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR2A	P35326	72 aa		2.9	□□□□□ -1.94
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		2.89	□□□□□ -1.95
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.83	□□□□□ -1.96
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR2D	P22532	72 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.78	□□□□□ -1.96
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ERCC3-208	ENST00000491292	MT1A	P04731	61 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ERCC3-208	ENST00000491292	MDN1	Q9NU22	5596 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-9	P26371	169 aa		2.58	□□□□□ -2
ERCC3-208	ENST00000491292	MT3	P25713	68 aa		2.54	□□□□□ -2
ERCC3-208	ENST00000491292	MT4	P47944	62 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		2.52	□□□□□ -2.01
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		2.48	□□□□□ -2.01
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		2.47	□□□□□ -2.01
ERCC3-208	ENST00000491292	NEB	P20929	6669 aa		2.45	□□□□□ -2.02
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		2.43	□□□□□ -2.02
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE1D	Q5T752	114 aa		2.36	□□□□□ -2.03
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.35	□□□□□ -2.03
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.34	□□□□□ -2.04
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.33	□□□□□ -2.04
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.27	□□□□□ -2.05
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.26	□□□□□ -2.05
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.17	□□□□□ -2.06
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.16	□□□□□ -2.06
ERCC3-208	ENST00000491292	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.13	□□□□□ -2.07
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.11	□□□□□ -2.07
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.1	□□□□□ -2.07
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		1.98	□□□□□ -2.09
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.95	□□□□□ -2.1
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		1.95	□□□□□ -2.1
ERCC3-208	ENST00000491292	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		1.95	□□□□□ -2.1
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		1.92	□□□□□ -2.1
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		1.92	□□□□□ -2.1
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		1.88	□□□□□ -2.11
ERCC3-208	ENST00000491292	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		1.83	□□□□□ -2.12
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-8	O75690	187 aa		1.74	□□□□□ -2.13
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		1.69	□□□□□ -2.14
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE1C	Q5T751	118 aa		1.69	□□□□□ -2.14
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	1.67	□□□□□ -2.14
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.66	□□□□□ -2.14
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.64	□□□□□ -2.15
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	1.61	□□□□□ -2.15
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.59	□□□□□ -2.15
ERCC3-208	ENST00000491292	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.47	□□□□□ -2.17
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		1.45	□□□□□ -2.18
ERCC3-208	ENST00000491292	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.25	□□□□□ -2.21
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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