RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.44□□□□□ -1.54
NISCH-213ENST00000489895 MT1MQ8N339 61 aa5.43□□□□□ -1.54
NISCH-213ENST00000489895 MT3P25713 68 aa5.3□□□□□ -1.56
NISCH-213ENST00000489895 RNF213Q63HN8 5207 aa5.25□□□□□ -1.57
NISCH-213ENST00000489895 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.24□□□□□ -1.57
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.2□□□□□ -1.58
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.18□□□□□ -1.58
NISCH-213ENST00000489895 MT4P47944 62 aa5.16□□□□□ -1.58
NISCH-213ENST00000489895 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.16□□□□□ -1.58
NISCH-213ENST00000489895 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.12□□□□□ -1.59
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.12□□□□□ -1.59
NISCH-213ENST00000489895 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.09□□□□□ -1.6
NISCH-213ENST00000489895 MT1AP04731 61 aa5.07□□□□□ -1.6
NISCH-213ENST00000489895 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.02□□□□□ -1.61
NISCH-213ENST00000489895 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.96□□□□□ -1.61
NISCH-213ENST00000489895 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-213ENST00000489895 PRM1P04553 51 aa4.9□□□□□ -1.62
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.89□□□□□ -1.63
NISCH-213ENST00000489895 LCE1DQ5T752 114 aa4.89□□□□□ -1.63
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.88□□□□□ -1.63
NISCH-213ENST00000489895 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.87□□□□□ -1.63
NISCH-213ENST00000489895 MUC2Q02817 5179 aa4.82□□□□□ -1.64
NISCH-213ENST00000489895 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.8□□□□□ -1.64
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
NISCH-213ENST00000489895 LCE4AQ5TA78 99 aa4.73□□□□□ -1.65
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.68□□□□□ -1.66
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.68□□□□□ -1.66
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.67□□□□□ -1.66
NISCH-213ENST00000489895 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.66□□□□□ -1.66
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.64□□□□□ -1.67
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.61□□□□□ -1.67
NISCH-213ENST00000489895 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.55□□□□□ -1.68
NISCH-213ENST00000489895 USH2AO75445 5202 aa4.36□□□□□ -1.71
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-9P26371 169 aa4.29□□□□□ -1.72
NISCH-213ENST00000489895 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
NISCH-213ENST00000489895 LCE1CQ5T751 118 aa4.12□□□□□ -1.75
NISCH-213ENST00000489895 LCE1EQ5T753 118 aa4.12□□□□□ -1.75
NISCH-213ENST00000489895 LCE1FQ5T754 118 aa4.12□□□□□ -1.75
NISCH-213ENST00000489895 SSPOA2VEC9 5147 aa4.05□□□□□ -1.76
NISCH-213ENST00000489895 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
NISCH-213ENST00000489895 NEBP20929 6669 aa4.03□□□□□ -1.76
NISCH-213ENST00000489895 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.02□□□□□ -1.77
NISCH-213ENST00000489895 KMT2DO14686 5537 aa3.95□□□□□ -1.78
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.94□□□□□ -1.78
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.92□□□□□ -1.78
NISCH-213ENST00000489895 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.78□□□□□ -1.8
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.73□□□□□ -1.81
NISCH-213ENST00000489895 MDN1Q9NU22 5596 aa3.72□□□□□ -1.81
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.58□□□□□ -1.84
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
NISCH-213ENST00000489895 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.53□□□□□ -1.84
NISCH-213ENST00000489895 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.5□□□□□ -1.85
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.35□□□□□ -1.87
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.35□□□□□ -1.87
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.33□□□□□ -1.88
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.26□□□□□ -1.89
NISCH-213ENST00000489895 MUC5ACP98088 5654 aa3.09□□□□□ -1.92
NISCH-213ENST00000489895 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.02□□□□□ -1.93
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.97□□□□□ -1.93
NISCH-213ENST00000489895 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.95□□□□□ -1.94
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-8O75690 187 aa2.94□□□□□ -1.94
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.83□□□□□ -1.96
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.65□□□□□ -1.98
NISCH-213ENST00000489895 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.57□□□□□ -2
NISCH-213ENST00000489895 PHGR1C9JFL3 82 aa2.57□□□□□ -2
NISCH-213ENST00000489895 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.45□□□□□ -2.02
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.23□□□□□ -2.05
NISCH-213ENST00000489895 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.17□□□□□ -2.06
NISCH-213ENST00000489895 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.55□□□□□ -2.16
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