RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
POLR1A-208ENST00000486964 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
POLR1A-208ENST00000486964 MT1BP07438 61 aa4.08□□□□□ -1.76
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4□□□□□ -1.77
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-5P60370 271 aa3.94□□□□□ -1.78
POLR1A-208ENST00000486964 MT1XP80297 61 aa3.94□□□□□ -1.78
POLR1A-208ENST00000486964 NEBP20929 6669 aa3.91□□□□□ -1.78
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.9□□□□□ -1.78
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.88□□□□□ -1.79
POLR1A-208ENST00000486964 LCE3AQ5TA76 89 aa3.85□□□□□ -1.79
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.82□□□□□ -1.8
POLR1A-208ENST00000486964 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.82□□□□□ -1.8
POLR1A-208ENST00000486964 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.81□□□□□ -1.8
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.79□□□□□ -1.8
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP10-12P60413 245 aa3.75□□□□□ -1.81
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.73□□□□□ -1.81
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP12-3P60328 96 aa3.7□□□□□ -1.82
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-9P26371 169 aa3.68□□□□□ -1.82
POLR1A-208ENST00000486964 INE1O15225 51 aa3.66□□□□□ -1.82
POLR1A-208ENST00000486964 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1A-208ENST00000486964 MDN1Q9NU22 5596 aa3.65□□□□□ -1.83
POLR1A-208ENST00000486964 KMT2DO14686 5537 aa3.64□□□□□ -1.83
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.59□□□□□ -1.84
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.59□□□□□ -1.84
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.55□□□□□ -1.84
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.53□□□□□ -1.84
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.53□□□□□ -1.84
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.51□□□□□ -1.85
POLR1A-208ENST00000486964 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.49□□□□□ -1.85
POLR1A-208ENST00000486964 MT3P25713 68 aa3.47□□□□□ -1.85
POLR1A-208ENST00000486964 MT1EP04732 61 aa3.45□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.44□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.44□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.44□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.42□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR2EP22531 72 aa3.41□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR2BP35325 72 aa3.41□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR2AP35326 72 aa3.41□□□□□ -1.86
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.39□□□□□ -1.87
POLR1A-208ENST00000486964 MT1LQ93083 61 aa3.38□□□□□ -1.87
POLR1A-208ENST00000486964 SPRR2DP22532 72 aa3.31□□□□□ -1.88
POLR1A-208ENST00000486964 LCE1FQ5T754 118 aa3.31□□□□□ -1.88
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.3□□□□□ -1.88
POLR1A-208ENST00000486964 MT1GP13640 62 aa3.29□□□□□ -1.88
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1A-208ENST00000486964 MT1MQ8N339 61 aa3.24□□□□□ -1.89
POLR1A-208ENST00000486964 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
POLR1A-208ENST00000486964 LCE1EQ5T753 118 aa3.2□□□□□ -1.9
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.17□□□□□ -1.9
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.1□□□□□ -1.91
POLR1A-208ENST00000486964 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.05□□□□□ -1.92
POLR1A-208ENST00000486964 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.04□□□□□ -1.92
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.96□□□□□ -1.94
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
POLR1A-208ENST00000486964 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.94□□□□□ -1.94
POLR1A-208ENST00000486964 MT4P47944 62 aa2.91□□□□□ -1.94
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.89□□□□□ -1.95
POLR1A-208ENST00000486964 MT1AP04731 61 aa2.87□□□□□ -1.95
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP12-4P60329 112 aa2.85□□□□□ -1.95
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.84□□□□□ -1.96
POLR1A-208ENST00000486964 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
POLR1A-208ENST00000486964 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.79□□□□□ -1.96
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP5-8O75690 187 aa2.7□□□□□ -1.98
POLR1A-208ENST00000486964 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.7□□□□□ -1.98
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.67□□□□□ -1.98
POLR1A-208ENST00000486964 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.6□□□□□ -1.99
POLR1A-208ENST00000486964 MUC5ACP98088 5654 aa2.57□□□□□ -2
POLR1A-208ENST00000486964 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
POLR1A-208ENST00000486964 PRM1P04553 51 aa2.53□□□□□ -2
POLR1A-208ENST00000486964 LCE1CQ5T751 118 aa2.13□□□□□ -2.07
POLR1A-208ENST00000486964 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.13□□□□□ -2.07
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.9□□□□□ -2.11
POLR1A-208ENST00000486964 PHGR1C9JFL3 82 aa1.77□□□□□ -2.13
POLR1A-208ENST00000486964 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.75□□□□□ -2.13
POLR1A-208ENST00000486964 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.64□□□□□ -2.15
POLR1A-208ENST00000486964 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.06□□□□□ -2.24
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